More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4224 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
260 aa  523  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6265  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.41 
 
 
280 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0454468  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.57 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0014  putative ParA-like (IncC) ATPase  36.72 
 
 
294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.118002 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0049  putative ParA partition protein  33.08 
 
 
261 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0038  plasmid partition protein  32.95 
 
 
361 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6602  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.46 
 
 
358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.95 
 
 
360 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0467548  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6445  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.96 
 
 
360 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67633  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.33 
 
 
246 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0782  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.37 
 
 
281 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  37.73 
 
 
259 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5812  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.4 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.4 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  35.4 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.4 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  35.4 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.4 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  35.4 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 
359 aa  96.3  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6343  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.460291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.94 
 
 
295 aa  95.5  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.7 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0047  replication-associated protein  28.32 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.8 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.7 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  32.13 
 
 
253 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.96 
 
 
256 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  32.2 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.72 
 
 
264 aa  94  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5392  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.89 
 
 
288 aa  92.8  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.28494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.94 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.95 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.13 
 
 
255 aa  92  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.7 
 
 
317 aa  92.4  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1320  chromosome segregation ATPase  30.45 
 
 
259 aa  92  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0040  ParaA family ATPase  29.52 
 
 
288 aa  92  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00514136  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  36.07 
 
 
256 aa  92  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3569  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 
252 aa  92  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.00440484 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.21 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.59 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  35.59 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  33.63 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  34.5 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.18 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1058  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.6 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  34.09 
 
 
254 aa  90.5  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.36 
 
 
267 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  31.7 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.44 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  33.79 
 
 
262 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
259 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.32 
 
 
273 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.55 
 
 
254 aa  89.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.48 
 
 
260 aa  89  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.74 
 
 
267 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4190  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.12 
 
 
274 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.94 
 
 
261 aa  88.6  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
259 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.72 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  32.59 
 
 
330 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  31.34 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
314 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  32.13 
 
 
323 aa  88.2  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  33.18 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.52 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  33.48 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.63 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.13 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.73 
 
 
294 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  35.29 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  33.18 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  30.15 
 
 
370 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.89 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.75 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.89 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.38 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.89 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.02 
 
 
284 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.88 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  33.48 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  33.18 
 
 
258 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  31.33 
 
 
305 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  35.81 
 
 
270 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.68 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
265 aa  86.3  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.44 
 
 
252 aa  86.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  33.79 
 
 
259 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.4 
 
 
264 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.02 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  33.04 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.02 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  31.6 
 
 
256 aa  86.3  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  34.22 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  29.33 
 
 
257 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.02 
 
 
259 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>