60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2730 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2730  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  354  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.881494  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4751  hypothetical protein  72.99 
 
 
174 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2543  hypothetical protein  40.12 
 
 
176 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1073  hypothetical protein  40.12 
 
 
176 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.195645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1383  hypothetical protein  38.51 
 
 
176 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1365  hypothetical protein  38.51 
 
 
176 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1352  hypothetical protein  38.51 
 
 
176 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0011  hypothetical protein  38.51 
 
 
176 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0146  hypothetical protein  35.33 
 
 
167 aa  88.2  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3862  hypothetical protein  44.71 
 
 
127 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155053  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4483  hypothetical protein  42.11 
 
 
182 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675401  hitchhiker  0.000216351 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1464  hypothetical protein  29.5 
 
 
167 aa  54.3  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0264996  normal  0.0590774 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  32.26 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  32.26 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  32.26 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  32.26 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  32.26 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  32.26 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  29.3 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  29.3 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  29.3 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  29.3 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4210  hypothetical protein  31.06 
 
 
181 aa  48.5  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  30.72 
 
 
159 aa  47.8  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  30.72 
 
 
159 aa  47.8  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  29.3 
 
 
159 aa  47.8  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3160  hypothetical protein  34.48 
 
 
117 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704298  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4537  hypothetical protein  24.36 
 
 
167 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  29.3 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  32.37 
 
 
181 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3114  transposase  43.4 
 
 
169 aa  45.1  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  41.51 
 
 
356 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  27.45 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  27.45 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  27.45 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1587  hypothetical protein  35 
 
 
80 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.280282  hitchhiker  0.00274669 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8431  hypothetical protein  36.45 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  41.51 
 
 
356 aa  42.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  41.51 
 
 
356 aa  42.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  41.51 
 
 
356 aa  42.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1018  hypothetical protein  27.42 
 
 
170 aa  42  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.299945 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1809  hypothetical protein  27.42 
 
 
170 aa  42  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00804246  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0371  hypothetical protein  23.68 
 
 
356 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  29.2 
 
 
160 aa  42  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>