18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3862 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3862  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  255  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155053  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2543  hypothetical protein  47.19 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1073  hypothetical protein  47.19 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.195645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0011  hypothetical protein  44.33 
 
 
176 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1352  hypothetical protein  44.33 
 
 
176 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1365  hypothetical protein  44.33 
 
 
176 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1383  hypothetical protein  44.33 
 
 
176 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2730  hypothetical protein  44.71 
 
 
174 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.881494  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4751  hypothetical protein  40.45 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0146  hypothetical protein  36.49 
 
 
167 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1587  hypothetical protein  54.55 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.280282  hitchhiker  0.00274669 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4483  hypothetical protein  41.82 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675401  hitchhiker  0.000216351 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  26.25 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  26.25 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  26.25 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  26.25 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  26.25 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  26.25 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.367142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>