13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0146 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0146  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  337  7e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4483  hypothetical protein  55.21 
 
 		 182 aa  148  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675401  hitchhiker  0.000216351 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0011  hypothetical protein  37.8 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1352  hypothetical protein  37.8 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1365  hypothetical protein  37.8 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1383  hypothetical protein  37.8 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1073  hypothetical protein  36.59 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.195645  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2543  hypothetical protein  36.59 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2730  hypothetical protein  35.33 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.881494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4751  hypothetical protein  34.64 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1917  hypothetical protein  33.51 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3862  hypothetical protein  36.49 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1587  hypothetical protein  32.61 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.280282  hitchhiker  0.00274669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>