24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1073 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2543  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1073  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.195645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0011  hypothetical protein  92.05 
 
 		 176 aa  343  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1352  hypothetical protein  92.05 
 
 		 176 aa  343  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1365  hypothetical protein  92.05 
 
 		 176 aa  343  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1383  hypothetical protein  92.05 
 
 		 176 aa  343  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4483  hypothetical protein  42.11 
 
 		 182 aa  104  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675401  hitchhiker  0.000216351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2730  hypothetical protein  40.12 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.881494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4751  hypothetical protein  42.76 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0146  hypothetical protein  36.59 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3862  hypothetical protein  47.19 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1917  hypothetical protein  28.29 
 
 		 243 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  35.9 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  35.9 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  35.9 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  35.9 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  35.9 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  35.9 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1587  hypothetical protein  44.68 
 
 		 80 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.280282  hitchhiker  0.00274669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  32.53 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  32.53 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  32.86 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  32.86 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  32.86 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>