12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4483 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4483  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  367  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675401  hitchhiker  0.000216351 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0146  hypothetical protein  55.21 
 
 
167 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0011  hypothetical protein  42.11 
 
 
176 aa  120  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1352  hypothetical protein  42.11 
 
 
176 aa  120  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1365  hypothetical protein  42.11 
 
 
176 aa  120  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1383  hypothetical protein  42.11 
 
 
176 aa  120  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1073  hypothetical protein  42.11 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.195645  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2543  hypothetical protein  42.11 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4751  hypothetical protein  35.29 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2730  hypothetical protein  32.58 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.881494  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3862  hypothetical protein  39.51 
 
 
127 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155053  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1917  hypothetical protein  28.22 
 
 
243 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.315835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>