18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1904 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1904  hypothetical protein  100 
 
 		 628 aa  1202    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.812108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  30 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  30.21 
 
 		 679 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  26.67 
 
 		 712 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  28.42 
 
 		 715 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  31.34 
 
 		 627 aa  64.3  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  26.64 
 
 		 708 aa  63.9  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  25.09 
 
 		 721 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  25.13 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  21.67 
 
 		 736 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  23.95 
 
 		 723 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  26.81 
 
 		 607 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  26.2 
 
 		 579 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  27.69 
 
 		 728 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  26.26 
 
 		 607 aa  51.2  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  23.54 
 
 		 604 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  28.24 
 
 		 827 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  31.18 
 
 		 686 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>