More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1307 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 259 aa  503  1e-141  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.365456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  38.13 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  39 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  35.83 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  34.14 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  33.73 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  33.73 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  37.86 
 
 		 393 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  36.51 
 
 		 393 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  33.6 
 
 		 260 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  34.29 
 
 		 265 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  36.8 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  34.5 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  35.66 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  37.6 
 
 		 397 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  35.07 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  38.04 
 
 		 391 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  36.22 
 
 		 265 aa  121  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  30.23 
 
 		 275 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  29.57 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  32.39 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  34.66 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4075  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 360 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  29.53 
 
 		 267 aa  111  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.46 
 
 		 402 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  32.39 
 
 		 392 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  32.52 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  30.74 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  28.29 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  34.95 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.47 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  35.15 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  30.16 
 
 		 396 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  35.32 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  32.8 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  30.35 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  32.54 
 
 		 389 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  35.32 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  32.58 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.75 
 
 		 400 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  31.13 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  30.17 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.61 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.22 
 
 		 393 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  29.63 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  33.49 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  31.93 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  30.81 
 
 		 377 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 		 393 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 		 393 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 		 393 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 		 393 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  27.83 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  34.43 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  34.43 
 
 		 270 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 262 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  33.49 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 396 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.59 
 
 		 393 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  32.55 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  29.8 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  32.55 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  32.55 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2233  3-oxoadipate enol-lactonase  32.79 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  32.55 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  29.23 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1118  3-oxoadipate enol-lactonase  33.73 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  28.89 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  28.14 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.14 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 		 262 aa  99.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.59 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  30.56 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  31.75 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.86 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  32.69 
 
 		 386 aa  97.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  30.17 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0162  3-oxoadipate enol-lactonase  29.51 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 288 aa  95.9  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28.03 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  29.88 
 
 		 264 aa  95.1  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>