19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1292 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1292  protein of unknown function DUF558  100 
 
 		 241 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137961  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0103  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  22.01 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0642611  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1597  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.36 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269441  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_002950  PG2156  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.87 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0162  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  22.71 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0412  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.14 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.502749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2960  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.61 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000379617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0519  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.05 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1169  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.51 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.979878  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03190  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.89 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4985  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.47 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5277  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.01 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1449  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.48 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110046  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2983  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.3 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1352  protein of unknown function DUF558  26.07 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.13252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05450  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.75 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0479  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.21 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4859  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.05 
 
 		 239 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.771335  normal  0.0487283 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0838  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.99 
 
 		 230 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.083399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>