More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0732 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0732  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
379 aa  745    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08210  butyryl-CoA dehydrogenase  56.92 
 
 
394 aa  438  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.249284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3506  butyryl-CoA dehydrogenase  58.82 
 
 
399 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.63 
 
 
396 aa  428  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.0345333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0405  butyryl-CoA dehydrogenase  61.76 
 
 
388 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30500  butyryl-CoA dehydrogenase  56.38 
 
 
385 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.262375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2247  butyryl-CoA dehydrogenase  57.94 
 
 
383 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.176219  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0034  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.25 
 
 
384 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211865  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4050  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.41 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.795074  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0028  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.47 
 
 
384 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.97 
 
 
385 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3266  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.83 
 
 
385 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1474  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.67 
 
 
384 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6228  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.33 
 
 
383 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0946  butyryl-CoA dehydrogenase  57.07 
 
 
384 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0982418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2151  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.86 
 
 
383 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3634  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.26 
 
 
386 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0647428  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50 
 
 
380 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1359  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.71 
 
 
381 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3319  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.07 
 
 
382 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.08 
 
 
380 aa  381  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6416  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.4 
 
 
384 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6410  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  53.54 
 
 
385 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3629  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  53.99 
 
 
386 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2554  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.66 
 
 
386 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3702  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.99 
 
 
386 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.646071  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12522  acyl-CoA dehydrogenase fadE19  54.23 
 
 
394 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3850  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.23 
 
 
388 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.428744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.26 
 
 
386 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0445399  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1707  butyryl-CoA dehydrogenase  52.32 
 
 
388 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000836039  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00480  butyryl-CoA dehydrogenase  50.52 
 
 
418 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1974  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.87 
 
 
382 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00328212  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.81 
 
 
381 aa  368  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.6 
 
 
381 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1387  butyryl-CoA dehydrogenase  50.91 
 
 
387 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.73 
 
 
377 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.18 
 
 
382 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  48.55 
 
 
381 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1405  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.9 
 
 
391 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000121185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06870  butyryl-CoA dehydrogenase  50.79 
 
 
395 aa  360  2e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2102  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.07 
 
 
394 aa  344  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.563951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.42 
 
 
379 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  45.89 
 
 
376 aa  334  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  45.89 
 
 
381 aa  334  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  45.89 
 
 
376 aa  334  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  45.89 
 
 
376 aa  333  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  45.89 
 
 
376 aa  333  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  45.89 
 
 
376 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  45.89 
 
 
381 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  45.89 
 
 
376 aa  332  5e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  45.62 
 
 
381 aa  332  8e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.89 
 
 
382 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.88 
 
 
383 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.89 
 
 
376 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.28 
 
 
389 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.36 
 
 
376 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0202  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.69 
 
 
382 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221874  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.35 
 
 
383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.91 
 
 
379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.7 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  46.17 
 
 
379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.62 
 
 
380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.19 
 
 
381 aa  325  6e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  45.91 
 
 
379 aa  325  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.58 
 
 
379 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  46.17 
 
 
379 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  46.17 
 
 
379 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  44.85 
 
 
380 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  46.17 
 
 
379 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  45.91 
 
 
379 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  43.5 
 
 
379 aa  321  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  45.91 
 
 
379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  45.91 
 
 
379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  45.65 
 
 
379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  44.03 
 
 
379 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.65 
 
 
379 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.5 
 
 
380 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.6 
 
 
379 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0439927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.83 
 
 
377 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2299  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.6 
 
 
379 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.71 
 
 
379 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.24 
 
 
402 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  42.97 
 
 
379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  43.27 
 
 
379 aa  310  4e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.5 
 
 
389 aa  308  8e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1647  butyryl-CoA dehydrogenase  49.08 
 
 
379 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1570  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.77 
 
 
383 aa  308  9e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.74 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  42.44 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  42.44 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.99 
 
 
376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.86 
 
 
386 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>