213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0722 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
189 aa  379  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.69 
 
 
188 aa  124  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.93 
 
 
191 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.44 
 
 
191 aa  122  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.35 
 
 
187 aa  120  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.2 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.2 
 
 
190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0509  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.59 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.91 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.51 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.45 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.64 
 
 
190 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40 
 
 
191 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  43.53 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.34 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.44 
 
 
196 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.77 
 
 
192 aa  111  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.53 
 
 
192 aa  111  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.12 
 
 
192 aa  111  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.28 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  37.79 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.86 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.53 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  43.43 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.64 
 
 
191 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.08 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  39.88 
 
 
181 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  42.69 
 
 
190 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.18 
 
 
185 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  43.6 
 
 
190 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1737  ATP--cobalamin adenosyltransferase  33.73 
 
 
195 aa  107  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.22 
 
 
191 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.43 
 
 
185 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1904  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.12 
 
 
177 aa  106  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.43 
 
 
185 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.24 
 
 
192 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0552  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.29 
 
 
170 aa  105  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2130  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.7 
 
 
195 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  decreased coverage  0.00205688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.64 
 
 
197 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  38.24 
 
 
192 aa  104  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  41.04 
 
 
194 aa  104  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.46 
 
 
184 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  37.21 
 
 
190 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.05 
 
 
190 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0666  cobalamin adenosyltransferase  42.11 
 
 
190 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.264853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  37.79 
 
 
192 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.18 
 
 
192 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.15 
 
 
188 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.76 
 
 
179 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  34.34 
 
 
182 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.2 
 
 
190 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2349  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40 
 
 
177 aa  102  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.952364  normal  0.0113032 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.59 
 
 
192 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1401  ATP--cobalamin adenosyltransferase  37.1 
 
 
193 aa  101  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111413  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.31 
 
 
186 aa  100  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.18 
 
 
189 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  38.95 
 
 
195 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.52 
 
 
190 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.24 
 
 
192 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1118  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.05 
 
 
187 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00598817  normal  0.855545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.7 
 
 
195 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  35.8 
 
 
189 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.95 
 
 
195 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  34.34 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0130  ATP--cobalamin adenosyltransferase  36.21 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.77 
 
 
190 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  34.66 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.41 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.2 
 
 
183 aa  98.6  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  36.52 
 
 
192 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1388  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.71 
 
 
193 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00323474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1499  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.71 
 
 
193 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000121183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1778  ATP--cobalamin adenosyltransferase  34.52 
 
 
173 aa  97.8  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.95 
 
 
191 aa  97.8  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0212  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.55 
 
 
175 aa  97.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  37.99 
 
 
333 aa  97.1  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  33.16 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.87 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.28 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3022  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.92 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.26 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0098  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.07 
 
 
174 aa  97.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.552457  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  36.93 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1533  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.16 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000827294  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0392  ATP/cobalamin adenosyltransferase  37.72 
 
 
177 aa  97.1  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.499168  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  38.24 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  38.24 
 
 
336 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  38.24 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2316  ATP/cobalamin adenosyltransferase  37.72 
 
 
177 aa  95.9  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  38.24 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.24 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  35.23 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.24 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3812  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.71 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000130321  hitchhiker  3.4004899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  38.24 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  38.24 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.24 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1639  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  34.62 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000121298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  35.96 
 
 
192 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.72 
 
 
192 aa  95.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>