More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0582 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0582  carboxyl transferase  100 
 
 		 447 aa  893    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  46.91 
 
 		 527 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  46.22 
 
 		 527 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  46.82 
 
 		 531 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  45.18 
 
 		 531 aa  365  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  45.68 
 
 		 532 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  46.01 
 
 		 529 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  45.77 
 
 		 530 aa  361  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  45.89 
 
 		 551 aa  359  5e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  45.25 
 
 		 537 aa  359  5e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  43.72 
 
 		 510 aa  358  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  44.06 
 
 		 510 aa  358  9e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  46.26 
 
 		 542 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  46.26 
 
 		 536 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  45.48 
 
 		 529 aa  356  5e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  43.59 
 
 		 510 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  42.66 
 
 		 510 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  42.89 
 
 		 510 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  43.12 
 
 		 510 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  44.77 
 
 		 534 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  43.36 
 
 		 510 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  46.92 
 
 		 530 aa  352  5.9999999999999994e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  44.59 
 
 		 529 aa  352  7e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  42.89 
 
 		 510 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  43.59 
 
 		 510 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  44.65 
 
 		 526 aa  351  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  44.34 
 
 		 516 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  43.96 
 
 		 540 aa  351  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  42.66 
 
 		 515 aa  350  3e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  42.86 
 
 		 550 aa  350  4e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  43.36 
 
 		 510 aa  349  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2771  carboxyl transferase  43.36 
 
 		 510 aa  348  8e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  42.89 
 
 		 523 aa  348  8e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  43.96 
 
 		 527 aa  348  8e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  41.51 
 
 		 516 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1317  carboxyl transferase  43.59 
 
 		 510 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  43.36 
 
 		 510 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  45.06 
 
 		 536 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  42.25 
 
 		 542 aa  347  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  39.82 
 
 		 517 aa  346  6e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  42.73 
 
 		 517 aa  345  7e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  41.74 
 
 		 515 aa  345  7e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  41.8 
 
 		 510 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  43.02 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  42.56 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  43.02 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  44.34 
 
 		 541 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  41.24 
 
 		 518 aa  345  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  41.12 
 
 		 549 aa  343  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  42.49 
 
 		 508 aa  344  2e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  42.42 
 
 		 510 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  42.82 
 
 		 512 aa  344  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  41.34 
 
 		 510 aa  344  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  42.89 
 
 		 514 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  42.19 
 
 		 510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  39.82 
 
 		 518 aa  343  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  42.19 
 
 		 510 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  42.89 
 
 		 524 aa  343  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  42.09 
 
 		 518 aa  343  5e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  42.79 
 
 		 510 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  39.69 
 
 		 516 aa  342  8e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  41.63 
 
 		 510 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  42.86 
 
 		 516 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  42.19 
 
 		 510 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  41.11 
 
 		 510 aa  341  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  42.47 
 
 		 546 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  41.34 
 
 		 514 aa  340  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  41.26 
 
 		 510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  42.66 
 
 		 510 aa  340  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  40.18 
 
 		 511 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  40.49 
 
 		 510 aa  339  7e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  41.11 
 
 		 514 aa  339  8e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  39.74 
 
 		 516 aa  338  8e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  41.26 
 
 		 510 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  41.65 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  40.79 
 
 		 510 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  40.93 
 
 		 510 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  41.03 
 
 		 510 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  39.47 
 
 		 514 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  44.19 
 
 		 527 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  41.01 
 
 		 517 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  43.88 
 
 		 552 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  40.65 
 
 		 514 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  40.65 
 
 		 516 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  39.91 
 
 		 531 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  39.54 
 
 		 518 aa  337  2.9999999999999997e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  40.97 
 
 		 522 aa  336  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  42.17 
 
 		 531 aa  336  5e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2082  carboxyl transferase  41.67 
 
 		 510 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.0739179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  40.65 
 
 		 510 aa  336  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  42.3 
 
 		 519 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  40.65 
 
 		 519 aa  335  7.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  42.73 
 
 		 516 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  41.49 
 
 		 510 aa  335  9e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  42.53 
 
 		 513 aa  335  9e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  41.03 
 
 		 510 aa  335  9e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  40.42 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  42.15 
 
 		 510 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  42.07 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  38.74 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>