More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0105 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0105  crotonyl-CoA reductase  100 
 
 		 464 aa  955    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4114  crotonyl-CoA reductase  60.05 
 
 		 443 aa  550  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136176  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3612  crotonyl-CoA reductase  62.44 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3994  crotonyl-CoA reductase  59.4 
 
 		 451 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1252  crotonyl-CoA reductase  60.89 
 
 		 455 aa  539  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4051  crotonyl-CoA reductase  60.14 
 
 		 449 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.571827  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8814  crotonyl-CoA reductase  59.37 
 
 		 436 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0999  crotonyl-CoA reductase  59.86 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3690  crotonyl-CoA reductase  59.31 
 
 		 449 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1041  crotonyl-CoA reductase  59.91 
 
 		 449 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3014  crotonyl-CoA reductase  59.16 
 
 		 451 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1795  crotonyl-CoA reductase  56.78 
 
 		 450 aa  524  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.692745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4138  crotonyl-CoA reductase  58.71 
 
 		 443 aa  519  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3474  crotonyl-CoA reductase  59.27 
 
 		 441 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4755  crotonyl-CoA reductase  54.3 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1018  crotonyl-CoA reductase  55.48 
 
 		 460 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0121802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3664  crotonyl-CoA reductase  54.13 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1332  crotonyl-CoA reductase  45.48 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.382584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4182  crotonyl-CoA reductase  44.13 
 
 		 418 aa  307  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6221  crotonyl-CoA reductase  42.97 
 
 		 425 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1067  crotonyl-CoA reductase  42.08 
 
 		 424 aa  302  7.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3104  crotonyl-CoA reductase  39.79 
 
 		 426 aa  298  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1621  crotonyl-CoA reductase  40.67 
 
 		 421 aa  297  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000162503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2853  alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 		 430 aa  292  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2620  crotonyl-CoA reductase  40.05 
 
 		 430 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1195  crotonyl-CoA reductase  40.78 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0039  crotonyl-CoA reductase  40.62 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0332  crotonyl-CoA reductase  41.38 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0960  alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1105  crotonyl-CoA reductase  41.22 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3873  crotonyl-CoA reductase  39.53 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0288  crotonyl-CoA reductase  41.38 
 
 		 432 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0793  crotonyl-CoA reductase  39.53 
 
 		 435 aa  290  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3009  crotonyl-CoA reductase  39.79 
 
 		 430 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0037  crotonyl-CoA reductase  39.9 
 
 		 431 aa  286  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0364  crotonyl-CoA reductase  40.32 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3063  crotonyl-CoA reductase  39.12 
 
 		 427 aa  279  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4689  crotonyl-CoA reductase  36.57 
 
 		 401 aa  243  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0488  crotonyl-CoA reductase  36.81 
 
 		 414 aa  220  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5660  crotonyl-CoA reductase  44.9 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  30.52 
 
 		 338 aa  150  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 		 361 aa  143  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.11 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.72 
 
 		 337 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.12 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.77 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.91 
 
 		 339 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.54 
 
 		 342 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 		 337 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 		 339 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.14 
 
 		 342 aa  122  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.49 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.26 
 
 		 346 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.73 
 
 		 341 aa  120  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  24.87 
 
 		 333 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.33 
 
 		 332 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.07 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.8 
 
 		 332 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.8 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  24.8 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.38 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.56 
 
 		 333 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  27.46 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.12 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.27 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.02 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  27.42 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  26.14 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.54 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.72 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  25.68 
 
 		 331 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.8 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.01 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.3 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.68 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  25.68 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.01 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  26.83 
 
 		 333 aa  104  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  27.01 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  25.41 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.87 
 
 		 323 aa  103  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.91 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  28.34 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2633  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.68 
 
 		 367 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000713978  hitchhiker  0.00104342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.37 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3545  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.04 
 
 		 339 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.14 
 
 		 331 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.08 
 
 		 341 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.19 
 
 		 334 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.68 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  26.88 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.78 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.94 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.93 
 
 		 340 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>