74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_R0031 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0031  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.264796  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0012  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274355  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0018  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245872  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0047  tRNA-Ala  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000513142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0047  tRNA-Ala  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0054  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0194635  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6015  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0075  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0022  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331538  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0071  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0073  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t37  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295961  normal  0.0193801 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0021  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000859233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0002  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0058  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000693286  normal  0.541415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6008  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.458315 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0054  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876029  normal  0.742043 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6047  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0047  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.055133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0049  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0051  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0029  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0737058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0031  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0725806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0056  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000771632  normal  0.557555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0033  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.106425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0008  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.224087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t39  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304224  normal  0.0192594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t41  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0706595  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t01  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126488  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t29  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t31  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA36  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA38  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851121  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R34  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0022  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0018  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00619278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0019  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0062  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1140 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0043  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0029  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000383633  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0994  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0502689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0036  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0038  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000224976  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0025  tRNA-Ala  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0022  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0039  tRNA-Ala  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575536  normal  0.4318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna17  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0019  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000697155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0022  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0062  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374737  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0039  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0025  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0045  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0035  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna15  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.888051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0016  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0049  tRNA-Ala  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306832 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0003  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00193312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0013  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000457589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0057  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288839  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0077  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000402465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0085  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00934773  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2332  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0355369  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2246  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1456  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00170878  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1790  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.215677  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0025  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.03724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0002  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0047  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00129328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0033  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>