129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0043 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0043  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0028  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000383633  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0017  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0028  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0025  tRNA-Thr  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0088  tRNA-Thr  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000142546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0016  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0013  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000622484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0034  tRNA-Thr  87.01 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t07  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.222466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0003  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00291494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0012  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000603563  normal  0.0893983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t07  tRNA-Thr  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000225857  unclonable  0.000000193462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA67  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105718  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R87  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60040  tRNA-Thr  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.909692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08670  tRNA-Thr  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482106  hitchhiker  0.000524894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0016  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000237824  normal  0.0237533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0821  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0929777  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0045  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0019  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0144795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0084  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000286992  normal  0.992402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00059  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00077  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000431752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0008  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0091  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.13219e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0008  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000537274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0010  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114274  hitchhiker  0.00000872087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0039  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0088  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00198921  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2731  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.264397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2417  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000618371  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr01  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000642788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0024  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0720012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0061  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00680264  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0075  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192269  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0018  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0074  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0006  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000680631  normal  0.388884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0084  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.193841 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4207  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0107638  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4286  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.21666e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4702  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00885482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4720  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.2702999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5073  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168696  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5103  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000647348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0014  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000357359  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0094  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.115915  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0631  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000484892  normal  0.0738312 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2802  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000503689  normal  0.100014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0008  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000889632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0010  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.138282  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0010  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.3598  normal  0.190518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0106  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000701517  hitchhiker  0.00222111 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3568  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.607966  normal  0.920561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4427  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000793255  hitchhiker  0.0000458064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4025  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4696  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.54682e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0054  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0008  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000148165  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0081  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000871845  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3660  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4477  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000501815  hitchhiker  0.00000000000000791993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3695  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0596681  normal  0.112328 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4474  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000074305  hitchhiker  0.000220241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3589  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.236614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4355  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000300865  normal  0.983555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3588  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.25198  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4387  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000102716  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3758  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4551  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000359327  hitchhiker  0.00000000000130381 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4594  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.559283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5444  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000119489  hitchhiker  0.00131782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0088  tRNA-Thr  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0057  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0045  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0775671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0008  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079978  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4781  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140933  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0075  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000445566  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0020  tRNA-Thr  84.62 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0052  tRNA-Thr  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000639553  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0014  tRNA-Thr  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000293663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0067  tRNA-Thr  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.689375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0105  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288138  hitchhiker  0.0000019759 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0015  tRNA-Thr  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0031  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.264796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0010  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.332364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0012  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0065  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0007  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22668  hitchhiker  0.0000658151 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0310  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0029  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.217954 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0032  tRNA-Ile  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0045  tRNA-Ile  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0026  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0006  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000288516  hitchhiker  0.0000067546 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0015  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000257752  normal  0.024275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0015  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000756567  hitchhiker  0.00969138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>