59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3188 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3304  protease-associated PA domain protein  91.71 
 
 
567 aa  991    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3188  protease-associated PA  100 
 
 
567 aa  1127    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  47.59 
 
 
1053 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2937  protease-associated PA  45.03 
 
 
730 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  44.8 
 
 
1311 aa  96.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5463  hypothetical protein  36.02 
 
 
884 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  41.32 
 
 
887 aa  84.3  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  43.44 
 
 
1393 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3130  peptidase M36 fungalysin  45.7 
 
 
730 aa  83.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146648  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  42.62 
 
 
1393 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3023  protease-associated PA domain protein  45.03 
 
 
730 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  27.58 
 
 
792 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  48.81 
 
 
1220 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  31 
 
 
927 aa  80.9  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.26 
 
 
1323 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  35.54 
 
 
1042 aa  71.6  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.51 
 
 
1212 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04145  metalloprotease, putative  47.06 
 
 
935 aa  70.5  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.18498  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  50 
 
 
1215 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  46.84 
 
 
1407 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  46.84 
 
 
1407 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  46.84 
 
 
1406 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  45.57 
 
 
1407 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.8 
 
 
1212 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.68 
 
 
728 aa  64.7  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.8 
 
 
1212 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.28 
 
 
1212 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.82 
 
 
891 aa  57.4  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.87 
 
 
1160 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.46 
 
 
1776 aa  54.7  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1876  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45 
 
 
607 aa  54.3  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  36.55 
 
 
548 aa  53.9  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  35.2 
 
 
500 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1118  predicted protein  31.72 
 
 
595 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  27.66 
 
 
812 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2562  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.63 
 
 
1049 aa  51.6  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236427  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.43 
 
 
1283 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  33.33 
 
 
1809 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  41.94 
 
 
513 aa  50.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  34.53 
 
 
512 aa  50.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2300  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 
606 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  40.86 
 
 
503 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4627  serine protease  33.88 
 
 
702 aa  47.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  45.35 
 
 
515 aa  47.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  42.42 
 
 
1035 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  34.56 
 
 
502 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  37.5 
 
 
789 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2208  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.37 
 
 
605 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00762588  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  35.29 
 
 
1618 aa  45.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2413  cold-active alkaline serine protease  34.44 
 
 
526 aa  44.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06290  riken protein, putative  36.89 
 
 
616 aa  44.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  32.91 
 
 
514 aa  44.3  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  34.19 
 
 
501 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  34.19 
 
 
501 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2745  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.56 
 
 
521 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000278512  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  36.84 
 
 
1300 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  34.19 
 
 
501 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2637  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.56 
 
 
521 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000344019  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2570  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.56 
 
 
521 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>