147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1587 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1587  methylglyoxal synthase-like protein  100 
 
 
318 aa  634    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0187012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5146  hypothetical protein  45.64 
 
 
290 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886963  normal  0.124593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0061  hypothetical protein  46.39 
 
 
288 aa  218  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2653  hypothetical protein  45.64 
 
 
290 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146997  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3300  hypothetical protein  45.64 
 
 
290 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.861492  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1629  hypothetical protein  43.14 
 
 
296 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4019  hypothetical protein  41.53 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1252  Methylglyoxal synthase-like protein  32.89 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2651  methylglyoxal synthase  42.24 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2072  methylglyoxal synthase  39.69 
 
 
126 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.326665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0594  methylglyoxal synthase  38.6 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.444681  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0366  methylglyoxal synthase  35.34 
 
 
126 aa  71.6  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1248  methylglyoxal synthase  35.86 
 
 
126 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.10803  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1048  methylglyoxal synthase  38.6 
 
 
125 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171658  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0986  methylglyoxal synthase  38.6 
 
 
125 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1798  methylglyoxal synthase  36.99 
 
 
123 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061495  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0703  methylglyoxal synthase  32.21 
 
 
151 aa  68.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000171943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2504  methylglyoxal synthase  37.31 
 
 
130 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1240  methylglyoxal synthase  34.06 
 
 
158 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1982  methylglyoxal synthase  36.43 
 
 
143 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2382  methylglyoxal synthase  36.43 
 
 
146 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579764  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4588  methylglyoxal synthase  40.52 
 
 
133 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0985  methylglyoxal synthase  37.07 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2185  methylglyoxal synthase  35.71 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445857  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2625  methylglyoxal synthase  33.33 
 
 
158 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2719  methylglyoxal synthase  33.33 
 
 
158 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0792  methylglyoxal synthase  38.81 
 
 
140 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.131121 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2484  methylglyoxal synthase  38.79 
 
 
133 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1333  methylglyoxal synthase  36.84 
 
 
125 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1475  methylglyoxal synthase  35.09 
 
 
152 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.977307  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2082  methylglyoxal synthase  32.48 
 
 
120 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1163  methylglyoxal synthase  37.61 
 
 
128 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.618904  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2192  methylglyoxal synthase  35.97 
 
 
122 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4130  methylglyoxal synthase  36.21 
 
 
126 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070186  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1077  methylglyoxal synthase  31.03 
 
 
156 aa  62.8  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.330764  hitchhiker  0.000000505204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4444  methylglyoxal synthase  35.34 
 
 
126 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00533  methylglyoxal synthase  33.91 
 
 
136 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1979  methylglyoxal synthase  37.07 
 
 
147 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00620313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1906  methylglyoxal synthase  34.29 
 
 
146 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2526  methylglyoxal synthase  32.52 
 
 
160 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.487727 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  32.86 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0194  methylglyoxal synthase  35.97 
 
 
122 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3178  methylglyoxal synthase  36.49 
 
 
134 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3368  methylglyoxal synthase  34.48 
 
 
126 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378138  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0233  methylglyoxal synthase  32.76 
 
 
144 aa  60.1  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0496  methylglyoxal synthase  37.72 
 
 
144 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00967  methylglyoxal synthase  34.75 
 
 
152 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2680  methylglyoxal synthase  34.75 
 
 
152 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.788486  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1117  methylglyoxal synthase  34.48 
 
 
152 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000625657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00974  hypothetical protein  34.75 
 
 
152 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1139  methylglyoxal synthase  34.48 
 
 
152 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.482721 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2123  methylglyoxal synthase  35.96 
 
 
140 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336211  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1185  methylglyoxal synthase  34.48 
 
 
152 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.408572  normal  0.64136 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1072  methylglyoxal synthase  34.75 
 
 
152 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000670613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1078  methylglyoxal synthase  34.75 
 
 
152 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1127  methylglyoxal synthase  34.75 
 
 
152 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284898  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1151  methylglyoxal synthase  34.48 
 
 
152 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1034  methylglyoxal synthase  34.48 
 
 
152 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2633  methylglyoxal synthase  34.75 
 
 
152 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.264102  hitchhiker  0.000000301541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2156  methylglyoxal synthase  34.75 
 
 
152 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2352  methylglyoxal synthase  34.75 
 
 
152 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.318065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0707  methylglyoxal synthase  35.96 
 
 
120 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0611  methylglyoxal synthase  34.71 
 
 
155 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1257  methylglyoxal synthase  35.96 
 
 
131 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1459  methylglyoxal synthase  35.96 
 
 
131 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0146321  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_145  methylglyoxal synthase  35.34 
 
 
144 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2068  methylglyoxal synthase  31.45 
 
 
155 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  29.79 
 
 
435 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21210  methylglyoxal synthase  32 
 
 
148 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1706  methylglyoxal synthase  35 
 
 
130 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0918  methylglyoxal synthase  27.2 
 
 
158 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.502742  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0137  methylglyoxal synthase  31.9 
 
 
144 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1662  methylglyoxal synthase  35.96 
 
 
131 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1443  methylglyoxal synthase  35.96 
 
 
131 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1415  methylglyoxal synthase  35.96 
 
 
131 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0291451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1416  methylglyoxal synthase  35.96 
 
 
131 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1556  methylglyoxal synthase  35.96 
 
 
131 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2381  methylglyoxal synthase  35 
 
 
156 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0265896  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1700  methylglyoxal synthase  35.96 
 
 
131 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1627  methylglyoxal synthase  35.96 
 
 
131 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1589  methylglyoxal synthase  35.96 
 
 
131 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3756  methylglyoxal synthase  35.96 
 
 
131 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0987  methylglyoxal synthase  35.34 
 
 
130 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0240  methylglyoxal synthase  34.48 
 
 
126 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.822912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1097  methylglyoxal synthase  28.81 
 
 
143 aa  56.6  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0116  methylglyoxal synthase  31.25 
 
 
152 aa  56.6  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503426  normal  0.542869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3450  methylglyoxal synthase  33.33 
 
 
156 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000281554  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3603  cyclic nucleotide-binding protein  31.4 
 
 
322 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.181046  normal  0.223623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1310  methylglyoxal synthase  35.59 
 
 
154 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225102  normal  0.598668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1760  methylglyoxal synthase  32.2 
 
 
152 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0497546  hitchhiker  0.0006316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3100  methylglyoxal synthase  35.04 
 
 
159 aa  55.8  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000537533  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0241  methylglyoxal synthase  36.59 
 
 
137 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2894  methylglyoxal synthase  29.31 
 
 
162 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0227656 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1628  methylglyoxal synthase  30.53 
 
 
167 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652172  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0967  methylglyoxal synthase  35 
 
 
123 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2061  methylglyoxal synthase  35.59 
 
 
129 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337955  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1390  methylglyoxal synthase  35 
 
 
130 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1018  methylglyoxal synthase  36.97 
 
 
130 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.736302  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1235  methylglyoxal synthase  35 
 
 
130 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1244  methylglyoxal synthase  35 
 
 
130 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>