34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3621 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  100 
 
 		 906 aa  1829    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  34.58 
 
 		 911 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  35.08 
 
 		 913 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  32.31 
 
 		 930 aa  405  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  30.4 
 
 		 862 aa  365  3e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  30.51 
 
 		 872 aa  361  3e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  32.75 
 
 		 912 aa  327  7e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.2 
 
 		 916 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  30.63 
 
 		 896 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.66 
 
 		 940 aa  301  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  26.84 
 
 		 858 aa  275  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  26.84 
 
 		 858 aa  274  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  26.81 
 
 		 922 aa  257  7e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.16 
 
 		 935 aa  221  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  24.16 
 
 		 1047 aa  54.7  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  29.22 
 
 		 1047 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  23.5 
 
 		 908 aa  51.2  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  34.52 
 
 		 1016 aa  49.7  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  27.78 
 
 		 864 aa  49.3  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  19.87 
 
 		 960 aa  49.3  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  23.24 
 
 		 1045 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.46 
 
 		 836 aa  48.1  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  24.46 
 
 		 1044 aa  48.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  26.37 
 
 		 846 aa  47.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.48 
 
 		 957 aa  46.6  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  24.44 
 
 		 993 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1052 aa  47  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  26 
 
 		 1059 aa  45.8  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1016 aa  46.2  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  24.14 
 
 		 1052 aa  45.8  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  35.14 
 
 		 284 aa  44.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  26.99 
 
 		 951 aa  44.3  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  23.15 
 
 		 781 aa  44.3  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.62 
 
 		 1049 aa  44.3  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>