36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2184 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  100 
 
 
305 aa  596  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  29.93 
 
 
255 aa  59.3  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  30.25 
 
 
299 aa  58.9  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  31.33 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  31.33 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  31.33 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  31.33 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  31.33 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  31.33 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  31.33 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  32.61 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  32.73 
 
 
292 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  31.82 
 
 
288 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  31.82 
 
 
292 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  26 
 
 
273 aa  50.8  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3350  ferrous iron transport protein B  26.62 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0269256  normal  0.0624529 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  33.71 
 
 
272 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  33.71 
 
 
272 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  33.71 
 
 
272 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  29.2 
 
 
252 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  28 
 
 
272 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  31.37 
 
 
281 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  28.35 
 
 
275 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  26.28 
 
 
266 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  29.55 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  28.57 
 
 
242 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  32.89 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  32.18 
 
 
280 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  26.88 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5219  Abortive infection protein  34.15 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.297366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  30.63 
 
 
254 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  31.82 
 
 
254 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  31.03 
 
 
272 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  28.91 
 
 
412 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  31.03 
 
 
272 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  39.73 
 
 
602 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>