26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3486 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3486  putative lipoprotein  100 
 
 
271 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3752  putative lipoprotein  64.59 
 
 
250 aa  275  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2411  hypothetical protein  49.81 
 
 
246 aa  215  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1273  putative lipoprotein  46.22 
 
 
282 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.958512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6128  putative lipoprotein  45.74 
 
 
305 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1194  putative lipoprotein  44.22 
 
 
280 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1101  putative lipoprotein  44.22 
 
 
280 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2076  putative lipoprotein  47.1 
 
 
276 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128092  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4640  putative lipoprotein  42.51 
 
 
277 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1964  putative lipoprotein  42.4 
 
 
247 aa  135  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0700691  hitchhiker  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2330  putative lipoprotein  38.75 
 
 
244 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0461141  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1144  putative lipoprotein  37.93 
 
 
258 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0160  putative lipoprotein  38.64 
 
 
251 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2178  hypothetical protein  28.57 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1206  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.77 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.543862  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0129  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.04 
 
 
227 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.774772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0131  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.61 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0247  hypothetical protein  52 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0040  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.54 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1487  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.79 
 
 
243 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1515  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.79 
 
 
243 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.302384  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2589  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.05 
 
 
261 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06701  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.08 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.284053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0407  2-phosphosulfolactate phosphatase  24.57 
 
 
239 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.932789  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0614  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.58 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1051  2-phosphosulfolactate phosphatase  24.27 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00427368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>