33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3185 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  89.24 
 
 		 424 aa  722    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 421 aa  847    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0115  hypothetical protein  47.22 
 
 		 342 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  24.48 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  28.12 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  27.9 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 432 aa  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 104 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  26.8 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  39.36 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  38 
 
 		 476 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 68 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 68 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 68 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 478 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 		 452 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  36.47 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 68 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  32.17 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3127  helix-turn-helix domain protein  45.1 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.641093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  44.44 
 
 		 489 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 84 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40 
 
 		 481 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  46.94 
 
 		 142 aa  43.9  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2843  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 490 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0024  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 80 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  46.94 
 
 		 126 aa  43.1  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  33.87 
 
 		 91 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>