19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1927 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1927  O-antigen polymerase  100 
 
 
679 aa  1323    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4472  hypothetical protein  38.25 
 
 
509 aa  225  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0753  O-antigen polymerase  36.69 
 
 
476 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409596  hitchhiker  0.000594246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8491  O-antigen polymerase  34.26 
 
 
469 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6554  O-antigen polymerase  36.03 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  33.18 
 
 
489 aa  200  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0648  hypothetical protein  36.11 
 
 
462 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4126  O-antigen polymerase  37.16 
 
 
440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1739  O-antigen polymerase  32.86 
 
 
465 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  31.16 
 
 
419 aa  152  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  27.38 
 
 
456 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0066  O-antigen polymerase  27.47 
 
 
438 aa  99.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1072  hypothetical protein  27.46 
 
 
457 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  25.49 
 
 
437 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  22.31 
 
 
436 aa  48.9  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  25 
 
 
431 aa  47.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  25.71 
 
 
468 aa  47.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  24.08 
 
 
454 aa  44.3  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  24.88 
 
 
452 aa  44.3  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>