18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1925 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  791    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  48.12 
 
 		 523 aa  265  8e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1926  hypothetical protein  50.99 
 
 		 266 aa  228  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  33.24 
 
 		 545 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  36.25 
 
 		 1278 aa  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0186  hypothetical protein  31.73 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1000  Parallel beta-helix repeat protein  34.36 
 
 		 710 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349147  hitchhiker  0.00938388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6550  hypothetical protein  31.33 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.236585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0650  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1572  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.64 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0894  parallel beta-helix repeat protein  28.2 
 
 		 755 aa  79.7  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6551  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.18 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4479  hypothetical protein  30.57 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  29 
 
 		 642 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2522  hypothetical protein  30.94 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165755  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  24.13 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  38.71 
 
 		 621 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  38.71 
 
 		 621 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>