11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4479 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4479  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  720    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4483  hypothetical protein  49.08 
 
 		 439 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4489  hypothetical protein  50.74 
 
 		 208 aa  199  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1926  hypothetical protein  32.14 
 
 		 266 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  30.54 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  27.95 
 
 		 545 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  27.88 
 
 		 523 aa  75.9  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0186  hypothetical protein  28.27 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1572  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.19 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1278 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2522  hypothetical protein  25.46 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165755  normal  0.604183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>