110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0028 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0028  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0004  tRNA-Lys  92 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0005  tRNA-Lys  92 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0407  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.440416  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0829  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0006  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0057  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0007  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000068563  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0029  tRNA-Lys  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0013  tRNA-Thr  88.14 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162323  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0114  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00529639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0115  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000730422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0116  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000643012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0003  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000250623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0014  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000321021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0016  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000347926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0014  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4767600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0016  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.27479e-28 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt011  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0172063  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt06  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000258702  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000568305  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0061  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000960142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0005  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000194874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0196539  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1637  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.590858  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0048  tRNA-Asn  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.667802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0053  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0013  tRNA-Asn  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00234115  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09510  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.500506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000462002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5695  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000661366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5725  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000708731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000160288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0007424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000658436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000771561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  100 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000117481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000195724  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0054  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000342912  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0046  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0025  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0101  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0132  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000929612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0025  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0259954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0105  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000482088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0136  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00336688  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0022  tRNA-Lys  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0102  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0861  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5027  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000593186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5640  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5733  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5812  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000461866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0219  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000281593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4570  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  normal  0.109465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0786  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39935e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4996  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0060  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000216222  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0058  tRNA-Lys  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0108  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000933808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0180  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0824  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0733527  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0051  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0055  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0015  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000369215  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0055  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.758534  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0026  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000013123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0051  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0016  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0485613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0017  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0421283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0024  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.158579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0051  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000340535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>