31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_R0022 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_R0022  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0003  tRNA-Lys  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000250623  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0033  tRNA-Lys  88.41 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.773389  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0030  tRNA-Lys  90.91 
 
 
75 bp  56  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.981752  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0015  tRNA-Lys  87.72 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0009  tRNA-Lys  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0082  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000538289  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0049  tRNA-Lys  85.29 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.319616  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0011  tRNA-Lys  83.82 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0014  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000321021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0016  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000347926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0014  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4767600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0016  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.27479e-28 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0028  tRNA-Lys  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0030  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.407731  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0058  tRNA-Lys  84.48 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314069  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0056  tRNA-Lys  84.48 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0015  tRNA-Lys  86.96 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys03  tRNA-Lys  86.96 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00045675  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys02  tRNA-Lys  86.96 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000433132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0037  tRNA-Lys  84.48 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0220661  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0060  tRNA-Lys  84.48 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268431  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys01  tRNA-Lys  86.96 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000157886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0045  tRNA-Lys  86.96 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000363633  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0006  tRNA-Lys  86.96 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276121  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04831  tRNA-Lys  86.96 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>