46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0531 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0531  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 
361 aa  731    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1915  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 
528 aa  63.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0191786  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1045  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 
529 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0560  glycoside hydrolase family 57  33.01 
 
 
513 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0801  hypothetical protein  25 
 
 
536 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79707  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  24.55 
 
 
542 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0791  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
598 aa  53.5  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2325  glycoside hydrolase family protein  23.21 
 
 
537 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1356  hypothetical protein  27.74 
 
 
528 aa  52.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000931698  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0099  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 
533 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  23.13 
 
 
495 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0339  hypothetical protein  28.87 
 
 
534 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1330  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 
528 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00276943  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0045  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 
527 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1983  hypothetical protein  29.35 
 
 
529 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11711  hypothetical protein  33.05 
 
 
527 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0382  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 
529 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5064  hypothetical protein  25.19 
 
 
529 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224358 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0429  hypothetical protein  26.09 
 
 
528 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0867  hypothetical protein  25 
 
 
533 aa  50.1  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1304  hypothetical protein  29.03 
 
 
539 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1332  hypothetical protein  29.03 
 
 
539 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284091 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1889  hypothetical protein  29.03 
 
 
531 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.804439 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1076  hypothetical protein  34.57 
 
 
527 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2461  4-alpha-glucanotransferase  24.38 
 
 
672 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  23.13 
 
 
935 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3806  hypothetical protein  29.35 
 
 
529 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2840  glycosyl hydrolase, family 57  24.38 
 
 
672 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  27.21 
 
 
580 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0448  glycoside hydrolase family protein  22.46 
 
 
659 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1115  hypothetical protein  24.81 
 
 
532 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.096996  normal  0.0392314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  26.43 
 
 
398 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1135  hypothetical protein  24.06 
 
 
531 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1076  glycoside hydrolase family protein  24.06 
 
 
531 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1204  hypothetical protein  24.06 
 
 
531 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.117287  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11701  hypothetical protein  32.91 
 
 
527 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208787  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  27.13 
 
 
672 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  19.71 
 
 
456 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11551  hypothetical protein  28.89 
 
 
527 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  26.56 
 
 
706 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2006  Domain of unknown function DUF1957  23.4 
 
 
528 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1116  alpha amylase domain-containing protein  18.84 
 
 
654 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  27.27 
 
 
686 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1400  glycoside hydrolase family 57  27.14 
 
 
633 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  23.53 
 
 
407 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1940  hypothetical protein  24.75 
 
 
531 aa  42.7  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>