More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4777 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4777  methionine biosynthesis protein MetW  100 
 
 
194 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  90.72 
 
 
194 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  90.72 
 
 
194 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  85.49 
 
 
194 aa  348  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  85.94 
 
 
194 aa  348  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5287  methionine biosynthesis protein MetW  84.54 
 
 
195 aa  342  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  77.08 
 
 
193 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  78.95 
 
 
202 aa  307  6.999999999999999e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  78.38 
 
 
202 aa  305  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3583  hypothetical protein  73.96 
 
 
194 aa  294  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134233  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0322  methionine biosynthesis protein MetW  74.47 
 
 
194 aa  265  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2010  methionine biosynthesis protein MetW  52.49 
 
 
197 aa  204  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0026  hypothetical protein  52.91 
 
 
215 aa  204  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3401  methionine biosynthesis protein MetW  52.91 
 
 
211 aa  201  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3724  methionine biosynthesis protein MetW  52.38 
 
 
211 aa  201  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1727  methionine biosynthesis protein MetW  51.38 
 
 
197 aa  200  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6451  methionine biosynthesis MetW  50 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3116  methionine biosynthesis protein MetW  50 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3038  methionine biosynthesis protein MetW  50 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2486  methionine biosynthesis MetW  50 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3155  methionine biosynthesis protein MetW  50 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3100  methionine biosynthesis protein MetW  50 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.698233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0187  methionine biosynthesis MetW  54.14 
 
 
203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0144  methionine biosynthesis MetW  54.7 
 
 
203 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  50 
 
 
206 aa  193  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0181  methionine biosynthesis protein MetW  52.08 
 
 
204 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47681  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0156  methionine biosynthesis protein MetW  52.08 
 
 
204 aa  192  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3245  methionine biosynthesis protein MetW  52.08 
 
 
204 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0376  methionine biosynthesis protein MetW  52.08 
 
 
204 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2183  methionine biosynthesis protein MetW  52.08 
 
 
204 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0191  methionine biosynthesis protein MetW  52.08 
 
 
204 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3442  methionine biosynthesis protein MetW  52.08 
 
 
204 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2906  methionine biosynthesis protein MetW  52.08 
 
 
204 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3097  methionine biosynthesis protein MetW  51.04 
 
 
202 aa  191  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588077  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0060  methionine biosynthesis protein MetW  51.61 
 
 
202 aa  187  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866888  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4389  hypothetical protein  52.15 
 
 
202 aa  184  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2481  methionine biosynthesis MetW  45.65 
 
 
209 aa  184  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3645  DNA repair protein RadC  48.92 
 
 
198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0334  methionine biosynthesis protein MetW  52.17 
 
 
202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2059  methionine biosynthesis protein MetW  41.62 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118741  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0129  methionine biosynthesis MetW  55.56 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03030  methionine biosynthesis protein MetW  45.16 
 
 
199 aa  170  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.767976  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0413  methionine biosynthesis MetW  42.78 
 
 
205 aa  168  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3058  methionine biosynthesis MetW  44.21 
 
 
203 aa  168  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109944  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5098  methionine biosynthesis protein MetW  44.74 
 
 
212 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0374  hypothetical protein  42.49 
 
 
205 aa  166  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.826237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0488  methionine biosynthesis protein MetW  43.68 
 
 
206 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4971  methionine biosynthesis protein MetW  44.74 
 
 
206 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05070  putative methionine biosynthesis protein  43.68 
 
 
206 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5148  methionine biosynthesis protein MetW  44.74 
 
 
206 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.740945  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0367  methionine biosynthesis protein MetW  44.74 
 
 
206 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802939  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0531  methionine biosynthesis protein MetW  43.88 
 
 
200 aa  165  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5050  metW protein  43.16 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0473  methionine biosynthesis MetW  43.16 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5324  methionine biosynthesis MetW  41.58 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4333  methionine biosynthesis protein MetW  42.41 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0337  methionine biosynthesis protein MetW  43.24 
 
 
202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4156  methionine biosynthesis protein MetW  43.78 
 
 
206 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0292  methionine biosynthesis protein MetW  44.33 
 
 
201 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0468  methionine biosynthesis protein MetW  44.33 
 
 
201 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392633  hitchhiker  0.000505408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4067  methionine biosynthesis protein MetW  43.65 
 
 
196 aa  154  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554344  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0751  methionine biosynthesis protein MetW  38.14 
 
 
211 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  43.39 
 
 
208 aa  150  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3191  methionine biosynthesis protein MetW  46.15 
 
 
210 aa  148  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0713  methionine biosynthesis protein MetW  45.83 
 
 
197 aa  148  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.749349  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  44.02 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  44.02 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  44.02 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0950  methionine biosynthesis protein MetW  41.05 
 
 
204 aa  145  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.341803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2133  methionine biosynthesis protein MetW  38.62 
 
 
210 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  43.01 
 
 
214 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  44.02 
 
 
242 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1840  methionine biosynthesis MetW  40.11 
 
 
205 aa  141  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0560635  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1910  methionine biosynthesis protein MetW  42.78 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1836  methionine biosynthesis protein MetW  39.27 
 
 
200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0726  methionine biosynthesis protein MetW  43.48 
 
 
221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263476  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1426  methionine biosynthesis protein MetW  41.21 
 
 
229 aa  138  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  42.93 
 
 
220 aa  138  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3267  methionine biosynthesis MetW  41.58 
 
 
211 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0384  methionine biosynthesis protein MetW  46.15 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  46.39 
 
 
195 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  41.38 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  39.57 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  40.64 
 
 
222 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  46.79 
 
 
195 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  41.18 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0574  methionine biosynthesis protein MetW  39.78 
 
 
215 aa  127  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  39.57 
 
 
230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  39.57 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  40.11 
 
 
231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3135  methionine biosynthesis protein MetW  44.74 
 
 
201 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.147398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  39.57 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1469  methionine biosynthesis MetW protein  32.26 
 
 
201 aa  85.9  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.393551  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0924  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
247 aa  71.2  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  35.56 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
1523 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
1312 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 
1162 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
211 aa  55.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0696  methyltransferase  29.5 
 
 
217 aa  55.5  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>