28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4529 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4529  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3244  hypothetical protein  54.29 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0741047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3895  hypothetical protein  53.81 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0512  hypothetical protein  44.44 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0590  hypothetical protein  41.38 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  32.12 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  30.53 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4005  LemA family protein  32.49 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000752628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0271  LemA protein  33.33 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.497624  hitchhiker  0.00615451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  24.87 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  26.46 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  26.88 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  29.84 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  22.95 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  25 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  23.94 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  24.49 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  24.47 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  24.88 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  28.06 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  28.73 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  27.03 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  27.64 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  23.59 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  23.91 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  30.46 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  23.59 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  23.59 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>