25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4081 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  373  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  77.84 
 
 
184 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  77.25 
 
 
184 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  67.07 
 
 
221 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  60.96 
 
 
184 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  66.27 
 
 
183 aa  207  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  65.29 
 
 
171 aa  204  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  66.47 
 
 
185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  54.97 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0798  hypothetical protein  60.32 
 
 
185 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  0.0126197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1225  protein of unknown function DUF583  66.34 
 
 
189 aa  151  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  61.32 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  51.52 
 
 
223 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  47.52 
 
 
247 aa  89.4  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  46.46 
 
 
162 aa  84.3  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2023  hypothetical protein  39.07 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  29.66 
 
 
119 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  29.66 
 
 
119 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  28.81 
 
 
119 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1928  hypothetical protein  29.59 
 
 
220 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.284182 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  35.44 
 
 
109 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  27.55 
 
 
152 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1453  hypothetical protein  24.7 
 
 
212 aa  40.8  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  30.97 
 
 
172 aa  41.2  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  25.64 
 
 
131 aa  40.8  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0202286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>