19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3556 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3556  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  353  6.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.217786  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3596  putative transmembrane protein  35.85 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  28.19 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  28.43 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  32 
 
 		 171 aa  48.5  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  33.06 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  35.76 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  29.68 
 
 		 157 aa  47.8  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  29.73 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  29.34 
 
 		 161 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  29.34 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  29.34 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  29.22 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0260  hypothetical protein  26.92 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  29.34 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  28.67 
 
 		 158 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  28.14 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0877  putative transmembrane protein  32.59 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  27.34 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>