30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0431 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  100 
 
 
586 aa  1139    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  46.72 
 
 
550 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  47.75 
 
 
542 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  25.79 
 
 
555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  27.64 
 
 
552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  27.27 
 
 
551 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  27.63 
 
 
551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  27.03 
 
 
551 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  26.33 
 
 
558 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  27.8 
 
 
551 aa  124  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  26.67 
 
 
550 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  25.93 
 
 
545 aa  114  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  26.31 
 
 
552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  27.45 
 
 
545 aa  110  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  27.29 
 
 
548 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  22.2 
 
 
538 aa  97.1  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  30.45 
 
 
521 aa  93.6  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  25.37 
 
 
547 aa  91.3  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  26.43 
 
 
509 aa  90.1  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  27.03 
 
 
553 aa  87.4  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  29.89 
 
 
517 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  27.59 
 
 
578 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  25.23 
 
 
509 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  24.39 
 
 
624 aa  73.2  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  24.64 
 
 
536 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  26.96 
 
 
591 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1973  hypothetical protein  24.76 
 
 
525 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1972  hypothetical protein  40.22 
 
 
788 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.2775 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  24.13 
 
 
492 aa  53.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2671  hypothetical protein  25.18 
 
 
649 aa  50.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0148077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>