More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1875 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  100 
 
 
212 aa  424  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  100 
 
 
212 aa  424  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  40.78 
 
 
210 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.45 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0550  putative partition-related protein  42.23 
 
 
208 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.840811 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.97 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.53 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  39.02 
 
 
212 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.49 
 
 
206 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0189  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.92 
 
 
235 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  38.05 
 
 
207 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  37.02 
 
 
207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  37.02 
 
 
207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.02 
 
 
222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  37.02 
 
 
207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  37.02 
 
 
207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  37.02 
 
 
207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  37.02 
 
 
207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.02 
 
 
219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.02 
 
 
219 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.45 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.98 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  37.02 
 
 
331 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2655  putative partition-related protein  38.16 
 
 
221 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.634269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.54 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.54 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.54 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2389  putative partition-related protein  38.54 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.94 
 
 
205 aa  131  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4398  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.23 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.78 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  37.14 
 
 
213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.21 
 
 
213 aa  128  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  38.1 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2866  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.35 
 
 
206 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  38.66 
 
 
201 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.35 
 
 
206 aa  125  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110983  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.62 
 
 
205 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  37.02 
 
 
210 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  37.5 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.02 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3136  putative partition-related protein  37.98 
 
 
209 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0178894  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1298  putative partition-related protein  34.08 
 
 
224 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150444 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3113  hypothetical protein  33 
 
 
208 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.08 
 
 
211 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.97 
 
 
210 aa  91.7  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.55 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.42 
 
 
209 aa  89  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  30.53 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.53 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0205  putative partitioning protein ParA  27.01 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.52 
 
 
216 aa  82  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.13 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  29.78 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.13 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.79 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.13 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.13 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.93 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  37.58 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.53 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.53 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.01 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  36.53 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.53 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.45 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.53 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.72 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.53 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.45 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.53 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 
212 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.98 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.53 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.87 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.15 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.81 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.65 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  35.37 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.32 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.79 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.79 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.02 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.26 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.93 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.87 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.9 
 
 
217 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.5 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  34.78 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  32.02 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.33 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.15 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.15 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>