79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3079 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3079  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
248 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2974  beta-lactamase-like protein  97.62 
 
 
252 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2887  Beta-lactamase-like protein  89.47 
 
 
248 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5452  beta-lactamase domain-containing protein  67.08 
 
 
243 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3489  hypothetical protein  59.92 
 
 
242 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.969002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5304  hypothetical protein  53.81 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3660  beta-lactamase domain-containing protein  49.79 
 
 
239 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1524  hypothetical protein  49.37 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0461  hypothetical protein  48.48 
 
 
247 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.304933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0472  hypothetical protein  48.48 
 
 
247 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.249938  normal  0.535874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0448  hypothetical protein  48.48 
 
 
247 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0594  hypothetical protein  44.77 
 
 
240 aa  205  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0281  hypothetical protein  50.34 
 
 
163 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0229241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0538  Beta-lactamase-like  27.95 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5045  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521879  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4522  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88502  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0086  hypothetical protein  23.73 
 
 
213 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307031  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  25.36 
 
 
402 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2889  beta-lactamase domain-containing protein  24.8 
 
 
410 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.726482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 
402 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  25.71 
 
 
572 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  26.43 
 
 
579 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  24.27 
 
 
396 aa  55.5  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  26.95 
 
 
582 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  22.02 
 
 
396 aa  52.4  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 
387 aa  52.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2027  flavodoxin/nitric oxide synthase  20.47 
 
 
404 aa  52  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.719198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  26.24 
 
 
576 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  24.11 
 
 
404 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.11 
 
 
576 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  23.4 
 
 
418 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 
399 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.11 
 
 
576 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  26.74 
 
 
399 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0503  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 
401 aa  49.7  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0527629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.82 
 
 
575 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  23.19 
 
 
399 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.65 
 
 
574 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  24.11 
 
 
574 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.82 
 
 
575 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 
575 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  21.99 
 
 
405 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 
575 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 
387 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  24.37 
 
 
404 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  21.6 
 
 
387 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
397 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.36 
 
 
494 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  22.9 
 
 
505 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  28.97 
 
 
423 aa  46.2  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  21.6 
 
 
503 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  23.68 
 
 
407 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  24.11 
 
 
402 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  22.94 
 
 
395 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  22.12 
 
 
405 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 
407 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.79 
 
 
397 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  24.56 
 
 
425 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  21.2 
 
 
499 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2284  uncharacterized flavoprotein  25.48 
 
 
411 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014767  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  20.92 
 
 
401 aa  43.9  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  20.74 
 
 
500 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  20.49 
 
 
404 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 
393 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  22.43 
 
 
498 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  21.96 
 
 
401 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  21.96 
 
 
394 aa  43.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  22.94 
 
 
399 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  21.09 
 
 
406 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  22.7 
 
 
571 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  25.55 
 
 
395 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  24.29 
 
 
402 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  21.99 
 
 
575 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  21.96 
 
 
485 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  21.2 
 
 
493 aa  42.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  24.56 
 
 
407 aa  42  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>