33 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Tmel_0001  CDS  NC_009616  162  1475  1314  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001305268  unclonable  9.28481e-07  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0002  CDS  NC_009616  1517  1699  183  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001305269  unclonable  9.42879e-09  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0024  CDS  NC_009616  25504  27960  2457  ATPase  YP_001305289  unclonable  9.51044e-05  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0142  CDS  NC_009616  151944  153473  1530  abortive infection protein  YP_001305404  unclonable  3.24505e-06  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0143  CDS  NC_009616  153522  153917  396  hypothetical protein  YP_001305405  unclonable  3.33578e-08  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0144  CDS  NC_009616  154175  155788  1614  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001305406  unclonable  3.89108e-06  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0176  CDS  NC_009616  187844  188875  1032  S-layer domain-containing protein  YP_001305438  unclonable  3.42894e-07  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0278  CDS  NC_009616  287418  287615  198  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001305535  unclonable  1.41015e-08  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0504  CDS  NC_009616  538026  538568  543  50S ribosomal protein L10  YP_001305756  unclonable  3.40487e-08  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0564  CDS  NC_009616  598091  599914  1824  extracellular solute-binding protein  YP_001305816  unclonable  1.0438e-05  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0565  CDS  NC_009616  600064  600618  555  putative methyltransferase  YP_001305817  unclonable  6.47034e-08  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0566  CDS  NC_009616  600586  601356  771  ornithine carbamoyltransferase  YP_001305818  unclonable  1.38704e-07  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0828  CDS  NC_009616  868442  869527  1086  permease  YP_001306074  unclonable  4.27926e-07  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0829  CDS  NC_009616  869604  869867  264  regulatory protein, ArsR  YP_001306075  unclonable  1.11816e-08  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0830  CDS  NC_009616  869976  871313  1338  MATE efflux family protein  YP_001306076  unclonable  9.18772e-07  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0953  CDS  NC_009616  988633  989250  618  50S ribosomal protein L3  YP_001306199  unclonable  6.60439e-08  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0954  CDS  NC_009616  989288  989953  666  50S ribosomal protein L4  YP_001306200  unclonable  1.11144e-07  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1080  CDS  NC_009616  1104588  1104920  333  hypothetical protein  YP_001306325  unclonable  1.17667e-08  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1118  CDS  NC_009616  1144401  1144946  546  hypothetical protein  YP_001306358  unclonable  4.79092e-08  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1166  CDS  NC_009616  1187403  1187774  372  RNA-binding S1 domain-containing protein  YP_001306406  unclonable  3.91852e-08  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1188  CDS  NC_009616  1207476  1208975  1500  extracellular solute-binding protein  YP_001306427  unclonable  1.9193e-06  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1416  CDS  NC_009616  1416318  1417421  1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  YP_001306648  unclonable  6.79599e-07  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1585  CDS  NC_009616  1573288  1574511  1224  Beta-ketoacyl synthase-like protein  YP_001306814  unclonable  6.59177e-07  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1586  CDS  NC_009616  1574514  1574921  408  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  YP_001306815  unclonable  2.39696e-08  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1758  CDS  NC_009616  1746374  1747339  966  peptidase M23B  YP_001306982  unclonable  3.26005e-07  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1759  CDS  NC_009616  1747336  1748421  1086  small GTP-binding protein  YP_001306983  unclonable  5.55556e-07  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1806  CDS  NC_009616  1789010  1790317  1308  signal recognition particle protein  YP_001307026  unclonable  1.2194e-06  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1837  CDS  NC_009616  1820001  1822139  2139  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  YP_001307057  unclonable  3.32783e-05  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1849  CDS  NC_009616  1834363  1836207  1845  extracellular solute-binding protein  YP_001307069  unclonable  9.5247e-06  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1850  CDS  NC_009616  1836312  1836806  495  hypothetical protein  YP_001307070  unclonable  4.64698e-08  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_R0043  tRNA  NC_009616  679120  679206  87  tRNA-Tyr    unclonable  1.18909e-08  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_R0050  tRNA  NC_009616  961018  961092  75  tRNA-Glu    unclonable  9.33029e-09  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_R0051  tRNA  NC_009616  961096  961170  75  tRNA-Arg    unclonable  1.1528e-08  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>