249 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Gura_0022  CDS  NC_009483  30334  31056  723  Hsp33 protein  YP_001228813  unclonable  2.15576e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0096  CDS  NC_009483  136135  136734  600  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  YP_001228885  unclonable  1.10916e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0097  CDS  NC_009483  136843  137520  678  hypothetical protein  YP_001228886  unclonable  9.43879e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0125  CDS  NC_009483  176170  178026  1857  hypothetical protein  YP_001228914  unclonable  5.48778e-08  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0130  CDS  NC_009483  182970  184331  1362  DNA repair protein RadA  YP_001228919  unclonable  7.66532e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0131  CDS  NC_009483  184480  186123  1644  HEAT repeat-containing PBS lyase  YP_001228920  unclonable  2.20266e-08  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0141  CDS  NC_009483  196333  197265  933  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001228930  unclonable  4.69336e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0142  CDS  NC_009483  197280  198317  1038  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001228931  unclonable  8.25635e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0143  CDS  NC_009483  198394  199287  894  chaperone DnaJ domain-containing protein  YP_001228932  unclonable  5.24271e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0144  CDS  NC_009483  199443  200858  1416  protoporphyrinogen oxidase  YP_001228933  unclonable  6.1855e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0193  CDS  NC_009483  257008  258354  1347  sun protein  YP_001228982  unclonable  5.93735e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0288  CDS  NC_009483  348877  349350  474  hypothetical protein  YP_001229077  unclonable  7.94699e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0303  CDS  NC_009483  365565  365867  303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001229092  unclonable  3.92242e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0362  CDS  NC_009483  422874  423623  750  siroheme synthase  YP_001229151  unclonable  3.23001e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0371  CDS  NC_009483  434825  436012  1188  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001229160  unclonable  1.74578e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0372  CDS  NC_009483  436158  436583  426  DNA polymerase beta subunit  YP_001229161  unclonable  3.4054e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0373  CDS  NC_009483  437335  438258  924  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  YP_001229162  unclonable  2.97826e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0402  CDS  NC_009483  478421  478798  378  hypothetical protein  YP_001229191  unclonable  3.20565e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0499  CDS  NC_009483  576692  580831  4140  cytochrome C family protein  YP_001229287  unclonable  0.00294186  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0500  CDS  NC_009483  580928  585418  4491  cytochrome C family protein  YP_001229288  unclonable  0.00446809  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0606  CDS  NC_009483  727560  728639  1080  zinc finger SWIM domain-containing protein  YP_001229391  unclonable  2.22918e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0631  CDS  NC_009483  752792  754306  1515  ankyrin repeat-containing protein  YP_001229416  unclonable  2.58922e-08  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0640  CDS  NC_009483  761748  762137  390  hypothetical protein  YP_001229425  unclonable  7.18423e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0641  CDS  NC_009483  762294  763160  867  hypothetical protein  YP_001229426  unclonable  5.13772e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0646  CDS  NC_009483  769094  771139  2046  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  YP_001229431  unclonable  1.27282e-07  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0656  CDS  NC_009483  784720  786108  1389  hypothetical protein  YP_001229441  unclonable  9.88469e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0657  CDS  NC_009483  786222  786509  288  hypothetical protein  YP_001229442  unclonable  6.82616e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0666  CDS  NC_009483  796661  797185  525  HPP family protein+B94  YP_001229451  unclonable  6.11096e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0687  CDS  NC_009483  818676  821420  2745  putative PAS/PAC sensor protein  YP_001229472  unclonable  5.03319e-06  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0689  CDS  NC_009483  822257  824155  1899  TPR repeat-containing protein  YP_001229474  unclonable  7.34837e-08  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0694  CDS  NC_009483  828875  830206  1332  hypothetical protein  YP_001229479  unclonable  4.25344e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0715  CDS  NC_009483  847700  848119  420  TraR/DksA family transcriptional regulator  YP_001229498  unclonable  6.96876e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0716  CDS  NC_009483  848231  849577  1347  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  YP_001229499  unclonable  5.99844e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0717  CDS  NC_009483  849691  850176  486  putative nucleotide-binding protein  YP_001229500  unclonable  1.15495e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0762  CDS  NC_009483  905116  909435  4320  hypothetical protein  YP_001229544  unclonable  0.00323253  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0899  CDS  NC_009483  1063664  1064437  774  integral membrane protein TerC  YP_001229678  unclonable  4.07273e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0928  CDS  NC_009483  1098783  1100132  1350  replicative DNA helicase  YP_001229707  unclonable  7.28284e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0929  CDS  NC_009483  1100257  1100991  735  DNA repair protein RecO  YP_001229708  unclonable  6.28388e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_0958  CDS  NC_009483  1135831  1136037  207  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001229737  unclonable  1.77063e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1062  CDS  NC_009483  1264567  1268700  4134  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  YP_001229841  unclonable  0.00183724  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1063  CDS  NC_009483  1268830  1269201  372  30S ribosomal protein S12  YP_001229842  unclonable  1.1853e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1064  CDS  NC_009483  1269224  1269694  471  30S ribosomal protein S7  YP_001229843  unclonable  3.27115e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1100  CDS  NC_009483  1294667  1296232  1566  phosphodiesterase  YP_001229879  unclonable  2.38727e-08  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1168  CDS  NC_009483  1379244  1379492  249  FmdB family regulatory protein  YP_001229945  unclonable  2.32466e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1256  CDS  NC_009483  1483775  1486153  2379  ribonuclease  YP_001230033  unclonable  7.40438e-07  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1328  CDS  NC_009483  1567320  1567844  525  XRE family transcriptional regulator  YP_001230102  unclonable  7.25972e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1329  CDS  NC_009483  1567937  1568836  900  hypothetical protein  YP_001230103  unclonable  4.46037e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1330  CDS  NC_009483  1569007  1569678  672  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_001230104  unclonable  8.52899e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1331  CDS  NC_009483  1569850  1570365  516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  YP_001230105  unclonable  4.51491e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1332  CDS  NC_009483  1570509  1571678  1170  S-adenosylmethionine synthetase  YP_001230106  unclonable  1.24955e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1370  CDS  NC_009483  1611160  1611579  420  hypothetical protein  YP_001230144  unclonable  9.15569e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1371  CDS  NC_009483  1611696  1615010  3315  AsmA family protein  YP_001230145  unclonable  8.70938e-05  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1387  CDS  NC_009483  1630150  1631073  924  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001230161  unclonable  3.7205e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1418  CDS  NC_009483  1655813  1656577  765  regulatory protein, IclR  YP_001230192  unclonable  2.40863e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1419  CDS  NC_009483  1656698  1657006  309  hypothetical protein  YP_001230193  unclonable  2.59671e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1500  CDS  NC_009483  1749210  1750544  1335  carboxyl-terminal protease  YP_001230272  unclonable  7.0609e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1559  CDS  NC_009483  1813381  1814550  1170  rhodanese domain-containing protein  YP_001230328  unclonable  1.32868e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1560  CDS  NC_009483  1814807  1815772  966  rhodanese domain-containing protein  YP_001230329  unclonable  4.11556e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1578  CDS  NC_009483  1837186  1838613  1428  aldehyde dehydrogenase  YP_001230347  unclonable  8.14705e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1579  CDS  NC_009483  1838805  1838999  195  hypothetical protein  YP_001230348  unclonable  1.82578e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1588  CDS  NC_009483  1846338  1847606  1269  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  YP_001230357  unclonable  2.27474e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1589  CDS  NC_009483  1847834  1848067  234  hypothetical protein  YP_001230358  unclonable  2.14496e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1632  CDS  NC_009483  1894402  1895745  1344  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  YP_001230400  unclonable  9.30018e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1637  CDS  NC_009483  1901551  1902384  834  rhomboid family protein  YP_001230405  unclonable  2.80354e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1651  CDS  NC_009483  1912772  1914397  1626  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  YP_001230419  unclonable  2.0704e-08  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1669  CDS  NC_009483  1936486  1937529  1044  polysaccharide export protein  YP_001230437  unclonable  1.78188e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1728  CDS  NC_009483  2005434  2007371  1938  heat shock protein 90  YP_001230495  unclonable  1.67687e-07  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1771  CDS  NC_009483  2050564  2051496  933  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  YP_001230534  unclonable  1.05177e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1772  CDS  NC_009483  2051508  2051732  225  RNA chaperone Hfq  YP_001230535  unclonable  2.03944e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1824  CDS  NC_009483  2114235  2115305  1071  peptidase M24  YP_001230587  unclonable  1.32868e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1829  CDS  NC_009483  2118673  2119125  453  NUDIX hydrolase  YP_001230592  unclonable  9.06254e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1830  CDS  NC_009483  2119213  2119506  294  hypothetical protein  YP_001230593  unclonable  4.42352e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1831  CDS  NC_009483  2119750  2121168  1419  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  YP_001230594  unclonable  1.24706e-08  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1832  CDS  NC_009483  2121492  2122352  861  Fe-S cluster assembly protein NifU  YP_001230595  unclonable  4.50727e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1839  CDS  NC_009483  2133409  2134704  1296  hypothetical protein  YP_001230602  unclonable  3.17523e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1864  CDS  NC_009483  2162556  2165804  3249  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  YP_001230627  unclonable  6.11023e-05  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1884  CDS  NC_009483  2184469  2185644  1176  hypothetical protein  YP_001230647  unclonable  5.7578e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1898  CDS  NC_009483  2201452  2201931  480  hypothetical protein  YP_001230661  unclonable  5.81162e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1904  CDS  NC_009483  2207740  2208672  933  tRNA pseudouridine synthase B  YP_001230667  unclonable  4.15787e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1905  CDS  NC_009483  2208771  2209037  267  30S ribosomal protein S15  YP_001230668  unclonable  1.49248e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1932  CDS  NC_009483  2236849  2237520  672  cell division ATP-binding protein FtsE  YP_001230695  unclonable  6.82616e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1936  CDS  NC_009483  2241268  2241900  633  SARP family transcriptional regulator  YP_001230699  unclonable  1.485e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_1937  CDS  NC_009483  2242127  2243713  1587  Ig domain-containing protein  YP_001230700  unclonable  2.46116e-08  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2040  CDS  NC_009483  2386073  2387371  1299  natural resistance-associated macrophage protein  YP_001230803  unclonable  1.37009e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2041  CDS  NC_009483  2387446  2388726  1281  MgtE intracellular region  YP_001230804  unclonable  2.39361e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2042  CDS  NC_009483  2389117  2389899  783  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  YP_001230805  unclonable  2.69177e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2043  CDS  NC_009483  2389928  2390353  426  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  YP_001230806  unclonable  3.88253e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2056  CDS  NC_009483  2407036  2407644  609  hypothetical protein  YP_001230819  unclonable  1.15495e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2057  CDS  NC_009483  2408064  2408624  561  outer membrane lipoprotein Slp  YP_001230820  unclonable  6.42718e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2058  CDS  NC_009483  2409168  2409572  405  preprotein translocase subunit SecG  YP_001230821  unclonable  3.4404e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2059  CDS  NC_009483  2409639  2410394  756  triosephosphate isomerase  YP_001230822  unclonable  1.60979e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2163  CDS  NC_009483  2520953  2522296  1344  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  YP_001230923  unclonable  8.56883e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2164  CDS  NC_009483  2522458  2522871  414  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_001230924  unclonable  1.01301e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2165  CDS  NC_009483  2523043  2524131  1089  chemotaxis-specific methylesterase  YP_001230925  unclonable  1.78188e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2176  CDS  NC_009483  2536936  2537829  894  polyprenyl synthetase  YP_001230936  unclonable  1.07352e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2177  CDS  NC_009483  2537866  2538096  231  exodeoxyribonuclease VII small subunit  YP_001230937  unclonable  3.61923e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2178  CDS  NC_009483  2538340  2539650  1311  homoserine dehydrogenase  YP_001230938  unclonable  6.77281e-09  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2185  CDS  NC_009483  2544148  2544618  471  dCMP deaminase  YP_001230945  unclonable  4.65345e-11  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2186  CDS  NC_009483  2544759  2545490  732  hypothetical protein  YP_001230946  unclonable  1.64305e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Gura_2187  CDS  NC_009483  2545510  2546466  957  hypothetical protein  YP_001230947  unclonable  2.77501e-10  n/a    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>