More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0563 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  331  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 
135 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  44.06 
 
 
260 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  44.06 
 
 
260 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  44.06 
 
 
273 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  41.1 
 
 
255 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  36.81 
 
 
336 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  40.38 
 
 
252 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  40.38 
 
 
252 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  44.2 
 
 
164 aa  114  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  38.13 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  38.13 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  38.13 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  38.13 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  38.13 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  38.13 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  38.13 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  38.13 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  38.13 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  38.13 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  38.13 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  38.13 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  43.48 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  43.48 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  43.48 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  43.48 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  38.99 
 
 
253 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  38.99 
 
 
253 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  37.41 
 
 
190 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  38.99 
 
 
253 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  38.99 
 
 
260 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  39.86 
 
 
210 aa  110  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  39.86 
 
 
210 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  39.86 
 
 
210 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  41.78 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  44.52 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  38.36 
 
 
253 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  37.18 
 
 
251 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  37.18 
 
 
251 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  44.52 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  44.52 
 
 
171 aa  107  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  39.19 
 
 
249 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  39.51 
 
 
266 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.82 
 
 
252 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.82 
 
 
252 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  33.11 
 
 
186 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  33.11 
 
 
186 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  42.31 
 
 
254 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  42.31 
 
 
254 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  42.31 
 
 
254 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  42.31 
 
 
254 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  42.31 
 
 
254 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  43.9 
 
 
177 aa  103  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  43.9 
 
 
177 aa  103  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  43.9 
 
 
177 aa  103  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  43.9 
 
 
177 aa  103  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  43.9 
 
 
177 aa  103  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  38.1 
 
 
129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  38.1 
 
 
129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  38.1 
 
 
129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  38.1 
 
 
129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  38.1 
 
 
129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  33.11 
 
 
186 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  38.1 
 
 
129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  38.1 
 
 
129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  35.9 
 
 
235 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  38.51 
 
 
249 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3532  hypothetical protein  37.3 
 
 
129 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00922044  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3540  hypothetical protein  37.3 
 
 
129 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.718907 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  33.95 
 
 
259 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.71 
 
 
251 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  40.13 
 
 
254 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  40.13 
 
 
254 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  40.13 
 
 
254 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  40.13 
 
 
254 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  40.13 
 
 
254 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  40.13 
 
 
254 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  40.77 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  35.4 
 
 
260 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  35.85 
 
 
253 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  35.4 
 
 
260 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  35.4 
 
 
260 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  36.72 
 
 
131 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  35.4 
 
 
260 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  37.3 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  40.44 
 
 
176 aa  97.8  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  40.44 
 
 
176 aa  97.8  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  39.71 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  39.71 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  36.51 
 
 
129 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  36.51 
 
 
129 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  35.8 
 
 
250 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  35.8 
 
 
250 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  36.88 
 
 
252 aa  96.3  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  37.11 
 
 
252 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  37.11 
 
 
252 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  37.11 
 
 
252 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  44.27 
 
 
138 aa  96.3  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>