More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3145 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  98.04 
 
 		 212 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  100 
 
 		 173 aa  358  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  75.41 
 
 		 256 aa  298  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  73.66 
 
 		 257 aa  297  8e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  72.68 
 
 		 256 aa  286  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  64.55 
 
 		 256 aa  258  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  64.55 
 
 		 256 aa  258  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  65.08 
 
 		 256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  61.81 
 
 		 255 aa  254  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  64.02 
 
 		 256 aa  254  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  62.96 
 
 		 207 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  63.49 
 
 		 207 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  62.96 
 
 		 207 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  62.43 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  61.38 
 
 		 207 aa  246  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  63.59 
 
 		 256 aa  245  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  60.85 
 
 		 256 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  60.85 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  60.85 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  61.96 
 
 		 256 aa  237  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  59.69 
 
 		 256 aa  237  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  54.27 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  56.52 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  56.59 
 
 		 187 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  56.99 
 
 		 254 aa  220  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  56.45 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  56.45 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  56.99 
 
 		 254 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  53.72 
 
 		 261 aa  214  9e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  49.48 
 
 		 250 aa  195  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  50 
 
 		 256 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  51.09 
 
 		 250 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  51.09 
 
 		 250 aa  194  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.21 
 
 		 251 aa  194  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  48.24 
 
 		 260 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  48.02 
 
 		 259 aa  190  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  49.46 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  47.87 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  49.46 
 
 		 254 aa  188  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  49.46 
 
 		 254 aa  188  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  52.17 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  47.52 
 
 		 259 aa  187  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  50 
 
 		 250 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  49.23 
 
 		 251 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  49.23 
 
 		 251 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  48.91 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  48.91 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  49.46 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  50.28 
 
 		 258 aa  185  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  49.46 
 
 		 250 aa  184  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.72 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  47.24 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.21 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.21 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.21 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.21 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  46.53 
 
 		 259 aa  181  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  45.56 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  48.11 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  48.11 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  47.8 
 
 		 261 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  47.28 
 
 		 261 aa  174  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  45.6 
 
 		 264 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.47 
 
 		 258 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  29.32 
 
 		 261 aa  98.2  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.47 
 
 		 258 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.47 
 
 		 261 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.95 
 
 		 261 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.27 
 
 		 261 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42 
 
 		 257 aa  94.7  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  28.27 
 
 		 261 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.65 
 
 		 261 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  29.38 
 
 		 273 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.12 
 
 		 261 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.8 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3752  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.51014  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.43 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  34.23 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  38.2 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.38 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  34.34 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.76 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  31.25 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.7 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 266 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  35 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.05 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1567  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.56 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00051335  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  37.61 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  35.42 
 
 		 271 aa  62  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.05 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.2 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>