More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2887 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  100 
 
 
192 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  9.95394e-12  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  100 
 
 
192 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  3.64467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  100 
 
 
192 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.65498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  73.71 
 
 
195 aa  296  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  75.38 
 
 
190 aa  295  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.60031e-07  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  72.68 
 
 
195 aa  293  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  72.68 
 
 
195 aa  290  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  69.07 
 
 
195 aa  274  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  62.12 
 
 
198 aa  248  3e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  59.9 
 
 
197 aa  239  3e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  3.7652e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  59.39 
 
 
197 aa  238  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  5.87917e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  59.39 
 
 
197 aa  238  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  5.06013e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  59.39 
 
 
197 aa  238  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  59.39 
 
 
197 aa  238  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.08072e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  59.39 
 
 
197 aa  238  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  59.69 
 
 
196 aa  237  6e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  5.38048e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  59.69 
 
 
196 aa  237  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  5.06874e-10  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  58.88 
 
 
197 aa  236  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.10847e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  61.42 
 
 
197 aa  235  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  1.90441e-07  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  59.18 
 
 
241 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  59.18 
 
 
250 aa  231  4e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  59.18 
 
 
196 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  59.18 
 
 
196 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  59.18 
 
 
196 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  52.15 
 
 
211 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  50 
 
 
195 aa  180  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  54.66 
 
 
198 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  48.5 
 
 
200 aa  179  3e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  46.46 
 
 
212 aa  175  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  48.47 
 
 
209 aa  175  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  53.33 
 
 
185 aa  171  4e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  53.33 
 
 
185 aa  172  4e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  48.19 
 
 
194 aa  171  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  51 
 
 
200 aa  171  6e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.63848e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  54.49 
 
 
206 aa  171  7e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.75754e-08  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  49.72 
 
 
194 aa  170  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.6941e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  54.49 
 
 
203 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.98857e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  55.13 
 
 
206 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.25429e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  55.13 
 
 
203 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.69534e-09  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  55.13 
 
 
206 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  57.97 
 
 
204 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  49.26 
 
 
209 aa  167  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  56.03 
 
 
200 aa  167  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.5112e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  54.49 
 
 
206 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  7.98826e-07  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  54.49 
 
 
206 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  8.27789e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  54.49 
 
 
206 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  7.67299e-10  decreased coverage  7.11999e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  54.49 
 
 
206 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.63417e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  48.28 
 
 
209 aa  164  6e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  4.35816e-05  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  52.17 
 
 
187 aa  163  2e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  52.17 
 
 
187 aa  162  2e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  50.85 
 
 
186 aa  162  2e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  55.48 
 
 
184 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  56.03 
 
 
205 aa  160  8e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  9.76111e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  54.9 
 
 
210 aa  160  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  53.16 
 
 
206 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  49.44 
 
 
187 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  52.9 
 
 
189 aa  156  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  45.31 
 
 
189 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  48.81 
 
 
189 aa  155  5e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  48.54 
 
 
245 aa  154  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  54.19 
 
 
184 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  47.15 
 
 
201 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  1.03997e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  45.03 
 
 
192 aa  152  3e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  52.56 
 
 
201 aa  151  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.57049e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  44.75 
 
 
186 aa  149  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  45.73 
 
 
210 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  47.15 
 
 
187 aa  145  4e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  46.34 
 
 
185 aa  139  2e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  47.09 
 
 
184 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  48.21 
 
 
193 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 
186 aa  134  1e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  44.89 
 
 
188 aa  132  2e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  44.05 
 
 
190 aa  132  2e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  50 
 
 
185 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  50 
 
 
185 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  50 
 
 
185 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  50 
 
 
185 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  50 
 
 
185 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  50 
 
 
185 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  50 
 
 
178 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  50 
 
 
185 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  42.25 
 
 
199 aa  131  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  49.28 
 
 
181 aa  130  1e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  51.06 
 
 
181 aa  130  1e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  46.45 
 
 
199 aa  129  2e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  48.55 
 
 
181 aa  129  2e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  48.55 
 
 
181 aa  129  2e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  48.55 
 
 
181 aa  129  2e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  46.48 
 
 
198 aa  130  2e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  50.35 
 
 
181 aa  127  7e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  50.35 
 
 
181 aa  127  7e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  50.36 
 
 
193 aa  127  7e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  39.74 
 
 
208 aa  127  1e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  43.42 
 
 
213 aa  127  1e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  50 
 
 
202 aa  126  2e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  42.59 
 
 
218 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  49.28 
 
 
207 aa  125  4e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  47.06 
 
 
189 aa  124  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  48.94 
 
 
194 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  48.94 
 
 
194 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>