91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_4027 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_4027  TDP-fucosamine acetyltransferase  100 
 
 
245 aa  503  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0188  TDP-fucosamine acetyltransferase  97.96 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0518  TDP-fucosamine acetyltransferase  97.96 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0167  TDP-fucosamine acetyltransferase  62.45 
 
 
243 aa  291  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.735597  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4005  TDP-fucosamine acetyltransferase  56.61 
 
 
243 aa  263  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4197  TDP-fucosamine acetyltransferase  56.61 
 
 
243 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806841  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0162  TDP-fucosamine acetyltransferase  52.02 
 
 
238 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4154  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.18 
 
 
224 aa  218  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4213  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.18 
 
 
224 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4186  TDP-D-fucosamine acetyltransferase  49.18 
 
 
224 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5223  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.18 
 
 
224 aa  217  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.299582  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0207  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.18 
 
 
240 aa  214  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4150  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.39 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.981554  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4204  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.39 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4253  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.39 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4135  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.39 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4312  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.39 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.840549  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3998  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.16 
 
 
219 aa  209  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.489496  normal  0.14537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4131  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.25 
 
 
181 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4301  TDP-fucosamine acetyltransferase  48.76 
 
 
181 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4007  TDP-fucosamine acetyltransferase  48.76 
 
 
181 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03668  TDP-fucosamine acetyltransferase  48.76 
 
 
181 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03617  hypothetical protein  48.76 
 
 
181 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2998  acetyltransferase  29.06 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0342  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.85 
 
 
184 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4123  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
196 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494733  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3393  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4774  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5170  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
196 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3332  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
196 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.877658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  26.07 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2804  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.788725  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0011  streptothricin acetyltransferase  32.29 
 
 
180 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3192  putative streptothricin acetyltransferase  28.24 
 
 
184 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3185  streptothricin acetyltransferase  28.24 
 
 
184 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.95857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2961  streptothricin acetyltransferase  28.24 
 
 
184 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2948  streptothricin acetyltransferase  28.24 
 
 
185 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3197  streptothricin acetyltransferase, putative  28.24 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.288156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  26.25 
 
 
152 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2189  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
156 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0726  GCN5-related N-acetyltransferase  21.09 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3203  putative streptothricin acetyltransferase  25.26 
 
 
185 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  33.63 
 
 
167 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  hitchhiker  0.00000000407656 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1033  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
162 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  26.49 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1468  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
202 aa  46.2  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001918  hypothetical protein  31.03 
 
 
144 aa  45.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15634  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2339  GCN5-like N-acetyltransferase  25.88 
 
 
200 aa  45.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00797251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3710  acetyltransferase, GNAT family  34.67 
 
 
184 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1765  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
182 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.911189 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5685  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 
184 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  hitchhiker  0.00928035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1365  putative acetyltransferase  35.79 
 
 
165 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0621  GCN5-related N-acetyltransferase  25.56 
 
 
294 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3179  putative streptothricin acetyltransferase  27.06 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
154 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0154  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
150 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31200  acetyltransferase  31.62 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1453  acetyltransferase  30 
 
 
155 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  27.56 
 
 
166 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  38.1 
 
 
158 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2412  hypothetical protein  29.55 
 
 
143 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2559  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  41.07 
 
 
171 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  29.35 
 
 
154 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1453  acetyltransferase  31.17 
 
 
155 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2069  putative streptothricin acetyltransferase  25.88 
 
 
185 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0117  hypothetical protein  25.85 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
431 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0103  hypothetical protein  25.85 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1644  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.796176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1667  acetyltransferase, GNAT family  31.17 
 
 
155 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1597  acetyltransferase  31.17 
 
 
155 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1480  acetyltransferase  31.17 
 
 
155 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 
145 aa  42.4  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
270 aa  42.4  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
164 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.156182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
153 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
178 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
154 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000111542  hitchhiker  0.00933544 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0544  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
146 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2568  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
289 aa  42.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372205  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
170 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
162 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.312763 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04993  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09940)  26.79 
 
 
213 aa  42  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0636839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
172 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0680  hypothetical protein  32.22 
 
 
168 aa  42  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0695  hypothetical protein  32.22 
 
 
168 aa  42  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.107584  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1643  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
173 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157541  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0014  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.77 
 
 
147 aa  42  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268172  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>