52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0167 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0167  TDP-fucosamine acetyltransferase  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.735597  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0518  TDP-fucosamine acetyltransferase  62.45 
 
 
245 aa  293  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0188  TDP-fucosamine acetyltransferase  62.45 
 
 
245 aa  293  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4027  TDP-fucosamine acetyltransferase  62.45 
 
 
245 aa  291  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4197  TDP-fucosamine acetyltransferase  57.51 
 
 
243 aa  265  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4005  TDP-fucosamine acetyltransferase  57.69 
 
 
243 aa  265  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0162  TDP-fucosamine acetyltransferase  51.5 
 
 
238 aa  228  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0207  TDP-fucosamine acetyltransferase  48.56 
 
 
240 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4154  TDP-fucosamine acetyltransferase  50.21 
 
 
224 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3998  TDP-fucosamine acetyltransferase  50.65 
 
 
219 aa  218  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.489496  normal  0.14537 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4213  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.79 
 
 
224 aa  217  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4186  TDP-D-fucosamine acetyltransferase  49.79 
 
 
224 aa  217  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5223  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.79 
 
 
224 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.299582  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4150  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.59 
 
 
225 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.981554  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4204  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.59 
 
 
225 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4135  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.59 
 
 
225 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4312  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.59 
 
 
225 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.840549  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4253  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.59 
 
 
225 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4131  TDP-fucosamine acetyltransferase  51.03 
 
 
181 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4301  TDP-fucosamine acetyltransferase  50.52 
 
 
181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4007  TDP-fucosamine acetyltransferase  50.52 
 
 
181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03617  hypothetical protein  50.52 
 
 
181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03668  TDP-fucosamine acetyltransferase  50.52 
 
 
181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  29.58 
 
 
166 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 
174 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.884644  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.15 
 
 
175 aa  48.9  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2998  acetyltransferase  32.46 
 
 
235 aa  48.9  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14350  acetyltransferase (GNAT) family protein  20.43 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.395264  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36 
 
 
153 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1218  acetyltransferase  31.91 
 
 
155 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.065696  normal  0.121515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0022  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 
164 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.545701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
164 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.156182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  33.02 
 
 
162 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0098  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
160 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0621  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
291 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  40.28 
 
 
290 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
148 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.8 
 
 
291 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0388  GCN5-related N-acetyltransferase  31.96 
 
 
187 aa  42.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0310697  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  21.76 
 
 
267 aa  42.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0963  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.58 
 
 
157 aa  42.4  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  38.81 
 
 
171 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  37.31 
 
 
170 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3764  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 
169 aa  42.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
148 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0974186  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0726  GCN5-related N-acetyltransferase  19.33 
 
 
262 aa  42  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604873  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 
178 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3332  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
196 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.877658 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.93 
 
 
149 aa  41.6  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5170  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
196 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0011  streptothricin acetyltransferase  29.41 
 
 
180 aa  42  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>