23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_4186 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



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Replicon accession

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_4186  TDP-D-fucosamine acetyltransferase  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5223  TDP-fucosamine acetyltransferase  99.55 
 
 
224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.299582  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4213  TDP-fucosamine acetyltransferase  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4154  TDP-fucosamine acetyltransferase  98.66 
 
 
224 aa  446  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03617  hypothetical protein  99.45 
 
 
181 aa  363  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4007  TDP-fucosamine acetyltransferase  99.45 
 
 
181 aa  363  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4301  TDP-fucosamine acetyltransferase  99.45 
 
 
181 aa  363  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03668  TDP-fucosamine acetyltransferase  99.45 
 
 
181 aa  363  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4131  TDP-fucosamine acetyltransferase  97.79 
 
 
181 aa  358  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4253  TDP-fucosamine acetyltransferase  78.22 
 
 
225 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4135  TDP-fucosamine acetyltransferase  78.22 
 
 
225 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4312  TDP-fucosamine acetyltransferase  78.22 
 
 
225 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.840549  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4150  TDP-fucosamine acetyltransferase  77.78 
 
 
225 aa  354  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.981554  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4204  TDP-fucosamine acetyltransferase  77.78 
 
 
225 aa  352  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3998  TDP-fucosamine acetyltransferase  64.68 
 
 
219 aa  282  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.489496  normal  0.14537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4005  TDP-fucosamine acetyltransferase  53.45 
 
 
243 aa  237  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4197  TDP-fucosamine acetyltransferase  50.86 
 
 
243 aa  223  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0518  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.59 
 
 
245 aa  218  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0188  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.59 
 
 
245 aa  218  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4027  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.18 
 
 
245 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0167  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.79 
 
 
243 aa  217  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.735597  normal 
 
 
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NC_012912  Dd1591_0162  TDP-fucosamine acetyltransferase  47.9 
 
 
238 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0207  TDP-fucosamine acetyltransferase  44.44 
 
 
240 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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