41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4005 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4005  TDP-fucosamine acetyltransferase  100 
 
 		 243 aa  490  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4197  TDP-fucosamine acetyltransferase  87.24 
 
 		 243 aa  437  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806841  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0167  TDP-fucosamine acetyltransferase  57.69 
 
 		 243 aa  265  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.735597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4027  TDP-fucosamine acetyltransferase  56.61 
 
 		 245 aa  263  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0518  TDP-fucosamine acetyltransferase  56.61 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0188  TDP-fucosamine acetyltransferase  56.61 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0162  TDP-fucosamine acetyltransferase  57.45 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4186  TDP-D-fucosamine acetyltransferase  53.45 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5223  TDP-fucosamine acetyltransferase  53.45 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.299582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4213  TDP-fucosamine acetyltransferase  53.45 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4154  TDP-fucosamine acetyltransferase  53.02 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4150  TDP-fucosamine acetyltransferase  50.63 
 
 		 225 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.981554  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4312  TDP-fucosamine acetyltransferase  50.63 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.840549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4135  TDP-fucosamine acetyltransferase  50.63 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4253  TDP-fucosamine acetyltransferase  50.63 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4204  TDP-fucosamine acetyltransferase  50.63 
 
 		 225 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0207  TDP-fucosamine acetyltransferase  52.36 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3998  TDP-fucosamine acetyltransferase  49.78 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.489496  normal  0.14537 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03668  TDP-fucosamine acetyltransferase  55.79 
 
 		 181 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03617  hypothetical protein  55.79 
 
 		 181 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4301  TDP-fucosamine acetyltransferase  55.79 
 
 		 181 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4007  TDP-fucosamine acetyltransferase  55.79 
 
 		 181 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4131  TDP-fucosamine acetyltransferase  55.26 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0726  GCN5-related N-acetyltransferase  23.5 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604873  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3332  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.877658 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5170  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  34.91 
 
 		 145 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2998  acetyltransferase  25.21 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  27.4 
 
 		 154 aa  45.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000875  acetyltransferase GNAT family  27.52 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7351  hypothetical protein  36.71 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4093  GCN5-related N-acetyltransferase  29.6 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3393  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4774  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4123  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494733  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  27.97 
 
 		 166 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2765  GCN5-related N-acetyltransferase  45.83 
 
 		 159 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1203  acetyltransferase  25.58 
 
 		 161 aa  43.5  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2804  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.788725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2936  putative acyltransferase  29.09 
 
 		 299 aa  42  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 162 aa  41.6  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>