173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5170 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3332  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.877658 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5170  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4774  GCN5-related N-acetyltransferase  86.15 
 
 
225 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3393  GCN5-related N-acetyltransferase  86.15 
 
 
225 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2804  GCN5-related N-acetyltransferase  84.62 
 
 
222 aa  341  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.788725  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4123  GCN5-related N-acetyltransferase  86.15 
 
 
196 aa  340  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494733  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2189  GCN5-related N-acetyltransferase  38.86 
 
 
204 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1361  GCN5-related N-acetyltransferase  35.47 
 
 
180 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3710  acetyltransferase, GNAT family  41.67 
 
 
184 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2961  streptothricin acetyltransferase  40.57 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3185  streptothricin acetyltransferase  40.57 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.95857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3192  putative streptothricin acetyltransferase  40.57 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2948  streptothricin acetyltransferase  38.53 
 
 
185 aa  89  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3197  streptothricin acetyltransferase, putative  39.62 
 
 
184 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.288156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3203  putative streptothricin acetyltransferase  37.61 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3179  putative streptothricin acetyltransferase  35.19 
 
 
186 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1765  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
182 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.911189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2069  putative streptothricin acetyltransferase  35.19 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5685  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  hitchhiker  0.00928035 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0011  streptothricin acetyltransferase  39.58 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 
162 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0538  acetyltransferase  30.21 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.366943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  37.35 
 
 
161 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0188  TDP-fucosamine acetyltransferase  29.49 
 
 
245 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0518  TDP-fucosamine acetyltransferase  29.49 
 
 
245 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  40.21 
 
 
158 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000236474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4027  TDP-fucosamine acetyltransferase  33.33 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  34.82 
 
 
164 aa  51.6  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  39.29 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4496  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000087115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2489  acetyltransferase  33.33 
 
 
141 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2515  GCN5-related N-acetyltransferase  39.71 
 
 
270 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_004310  BR2151  acetyltransferase  32.62 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2150  GCN5-related N-acetyltransferase  45.76 
 
 
144 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2064  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.62 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.224111  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0191  acetyltransferase  29.03 
 
 
142 aa  48.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.73 
 
 
139 aa  48.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1368  acyltransferase protein  32.29 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427933  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0191  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
168 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 
368 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1867  ribosomal protein (S18)-alanine acetyltransferase  33.78 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.216572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4005  TDP-fucosamine acetyltransferase  31.86 
 
 
243 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2515  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.12 
 
 
378 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.291701  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0911  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.67 
 
 
184 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  31.25 
 
 
365 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4197  TDP-fucosamine acetyltransferase  31.86 
 
 
243 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806841  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2098  GCN5-related N-acetyltransferase  45.83 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.907585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
381 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  31.25 
 
 
365 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4703  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.625988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
166 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2343  acetyltransferase  31.76 
 
 
152 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  28.23 
 
 
363 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
261 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5104  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 
262 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5175  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 
262 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.505974  normal  0.0185711 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
152 aa  45.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0449  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
182 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0433  acetyltransferase  36 
 
 
165 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3192  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
262 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.1 
 
 
156 aa  45.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0014  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.89 
 
 
147 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268172  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  34.12 
 
 
364 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  34.88 
 
 
373 aa  45.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1175  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.07 
 
 
136 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.193233  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
173 aa  45.1  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  32.18 
 
 
154 aa  45.1  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2998  acetyltransferase  29.36 
 
 
235 aa  45.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.58 
 
 
152 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.71 
 
 
148 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.71 
 
 
148 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.71 
 
 
148 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  36.71 
 
 
148 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.71 
 
 
148 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
364 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.71 
 
 
148 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.71 
 
 
148 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.71 
 
 
148 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.71 
 
 
160 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1940  acetyltransferase  36.25 
 
 
263 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.315847  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
382 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1376  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000841135  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0615  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.19 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35760  hypothetical protein  34.55 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.28006e-16  decreased coverage  1.5308899999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4916  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  35.44 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000006262  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.97 
 
 
205 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.28 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
297 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25 
 
 
152 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
295 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1867  acetyltransferase  36.25 
 
 
252 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.968851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1066  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3064  putative acetyltransferase  34.55 
 
 
131 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3828  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
268 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.86874  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  36.14 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  34.52 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1585  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>