73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2629 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2629  SOS cell division inhibitor  100 
 
 
168 aa  344  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000371858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2540  SOS cell division inhibitor  100 
 
 
168 aa  344  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.19438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3200  SOS cell division inhibitor  99.4 
 
 
168 aa  342  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  hitchhiker  0.00343609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1755  SOS cell division inhibitor  67.26 
 
 
168 aa  211  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135467  hitchhiker  0.00000396208 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2857  SOS cell division inhibitor  60.95 
 
 
168 aa  184  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000546585  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2548  SOS cell division inhibitor  58.58 
 
 
168 aa  177  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00047922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1210  SOS cell division inhibitor  56.21 
 
 
164 aa  164  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000104842  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2685  cell division inhibitor SulA  57.05 
 
 
169 aa  147  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262344  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00969  hypothetical protein  57.05 
 
 
169 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000604934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1122  SOS cell division inhibitor  57.05 
 
 
169 aa  147  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000048454  normal  0.770648 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2358  SOS cell division inhibitor  57.05 
 
 
169 aa  147  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000503972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2162  SOS cell division inhibitor  57.05 
 
 
169 aa  147  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000180135  normal  0.227939 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2638  SOS cell division inhibitor  57.05 
 
 
169 aa  147  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000242491  unclonable  0.000000025128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1072  SOS cell division inhibitor  57.05 
 
 
169 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000394327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1067  SOS cell division inhibitor  57.05 
 
 
169 aa  147  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.84459e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00962  SOS cell division inhibitor  57.05 
 
 
169 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000284477  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1146  SOS cell division inhibitor  51.95 
 
 
169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0126315  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2697  SOS cell division inhibitor  58.57 
 
 
164 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000388147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1134  SOS cell division inhibitor  51.95 
 
 
169 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0155538  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1112  SOS cell division inhibitor  51.95 
 
 
169 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00640021  hitchhiker  0.00133403 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1180  SOS cell division inhibitor  51.95 
 
 
169 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1029  SOS cell division inhibitor  51.95 
 
 
169 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000336397  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1470  SOS cell division inhibitor  52.66 
 
 
171 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000194429  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2006  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like  32.81 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368936  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  34.88 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  34.74 
 
 
170 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  34.74 
 
 
170 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  34.74 
 
 
170 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  34.38 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  31.52 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  34.74 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  32.29 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  32.46 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  32.46 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  32.99 
 
 
170 aa  58.2  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  34.07 
 
 
170 aa  58.2  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  34.07 
 
 
170 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  34.07 
 
 
170 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  30.25 
 
 
169 aa  57.4  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  31.87 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  31.52 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  30.69 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25150  hypothetical protein  28.12 
 
 
161 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  32.32 
 
 
156 aa  51.2  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3511  cell division inhibitor, putative  31.31 
 
 
156 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  28.21 
 
 
290 aa  50.8  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1786  hypothetical protein  30.65 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  28.21 
 
 
278 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3284  cell division inhibitor, putative  32.32 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.899997  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  28.89 
 
 
268 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3873  SOS cell division inhibitor SulA  32.32 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2151  hypothetical protein  28.36 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1658  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  28.57 
 
 
158 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271985  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  31.85 
 
 
223 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3600  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like protein  31.31 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00249285  normal  0.513615 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  31.11 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1682  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  31.31 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292047  normal  0.171923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2142  cell division inhibitor-related protein  29.37 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  32.22 
 
 
228 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1586  SOS cell division inhibitor SulA  29.13 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.584866 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  24.56 
 
 
230 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  34.65 
 
 
206 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  34.65 
 
 
206 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  34 
 
 
216 aa  42.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  29.91 
 
 
920 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  29.91 
 
 
236 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  29.91 
 
 
236 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  29.91 
 
 
236 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  29.91 
 
 
236 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  29.91 
 
 
236 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  29.91 
 
 
236 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  25.86 
 
 
244 aa  40.8  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2235  hypothetical protein  26.83 
 
 
136 aa  40.8  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.27179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>