More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2065 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  100 
 
 
292 aa  579  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  98.29 
 
 
292 aa  566  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  80.82 
 
 
292 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  69.44 
 
 
291 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  54.67 
 
 
289 aa  304  1e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  53.92 
 
 
294 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  54.61 
 
 
293 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  53.12 
 
 
292 aa  295  5e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  54.79 
 
 
292 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  51.03 
 
 
291 aa  276  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  53.26 
 
 
293 aa  275  8e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  50.35 
 
 
290 aa  270  3e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  52.98 
 
 
290 aa  269  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  50.7 
 
 
283 aa  269  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  51.06 
 
 
283 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  51.06 
 
 
283 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  51.06 
 
 
283 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  51.06 
 
 
283 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  50.7 
 
 
283 aa  265  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  50.7 
 
 
283 aa  265  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  50.7 
 
 
283 aa  265  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  50.7 
 
 
283 aa  265  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  50.7 
 
 
283 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  50.7 
 
 
283 aa  265  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  50.7 
 
 
283 aa  265  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  50.7 
 
 
283 aa  265  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  50.7 
 
 
283 aa  265  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  50.7 
 
 
283 aa  265  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  50 
 
 
292 aa  263  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  48.63 
 
 
296 aa  263  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  48.63 
 
 
296 aa  263  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  50.17 
 
 
294 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.49192e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  50.53 
 
 
290 aa  261  7e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  51.06 
 
 
283 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  47.8 
 
 
302 aa  260  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  50.89 
 
 
292 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  49.31 
 
 
292 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.86 
 
 
289 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  50.35 
 
 
283 aa  258  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  48.97 
 
 
294 aa  258  9e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  48.14 
 
 
291 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  48.94 
 
 
283 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  49.46 
 
 
292 aa  256  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  48.95 
 
 
285 aa  253  2e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  49.15 
 
 
292 aa  253  2e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  49.15 
 
 
292 aa  253  2e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  47.74 
 
 
287 aa  253  4e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  48.29 
 
 
294 aa  252  5e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  48.81 
 
 
291 aa  252  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  49.82 
 
 
285 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  49.82 
 
 
285 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.40304e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  49.82 
 
 
285 aa  250  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  4.83484e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  48.95 
 
 
285 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  47.39 
 
 
287 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  48.12 
 
 
291 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  48.44 
 
 
283 aa  241  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4185  elongation factor Ts  46.59 
 
 
287 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1592  elongation factor Ts  46.59 
 
 
287 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4081  elongation factor Ts  46.59 
 
 
287 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  46.5 
 
 
287 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  45.08 
 
 
294 aa  239  3e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.72472e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  47.87 
 
 
291 aa  239  3e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  4.39027e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.19 
 
 
303 aa  239  3e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1147  elongation factor Ts  46.59 
 
 
287 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  48.58 
 
 
289 aa  235  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  45.61 
 
 
296 aa  234  1e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  49.33 
 
 
298 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  49.33 
 
 
298 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  50 
 
 
303 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.18698e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  45.52 
 
 
293 aa  232  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  45.88 
 
 
293 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  45.88 
 
 
293 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  45.88 
 
 
293 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  49.66 
 
 
298 aa  232  7e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  47.5 
 
 
287 aa  231  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  45.88 
 
 
293 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  45.88 
 
 
293 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  45.88 
 
 
293 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  46.77 
 
 
310 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.00093e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  46.24 
 
 
293 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  45.52 
 
 
293 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  47 
 
 
290 aa  229  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  45.52 
 
 
293 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  45.16 
 
 
293 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  45.16 
 
 
293 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  45.16 
 
 
293 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  45.16 
 
 
294 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  45.16 
 
 
293 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  45.16 
 
 
293 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  45.16 
 
 
293 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  45.83 
 
 
312 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  49.66 
 
 
283 aa  226  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.33846e-07  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  46.59 
 
 
292 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  47.75 
 
 
286 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  45.52 
 
 
292 aa  226  4e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  50 
 
 
306 aa  225  5e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  44.88 
 
 
301 aa  225  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1484  elongation factor Ts  47.52 
 
 
289 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  44.44 
 
 
293 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17070  elongation factor Ts  47.52 
 
 
289 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>