67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2392 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  248  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  43.93 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.55 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  42.06 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.11 
 
 		 120 aa  84.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  43.3 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.24 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.25 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.21 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.52 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  38.83 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  34.31 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  38.54 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  32.04 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.5 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  42.11 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.94 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0559  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.75 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.98 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.01 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  32.35 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  36.84 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  35.96 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3084  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.16 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.58 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.99 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.46 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.31 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.36 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  35.14 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 		 153 aa  48.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.23 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  34.25 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.49 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.29 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.63 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  29.63 
 
 		 401 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.81 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2008  Rieske (2Fe-2S) region  29.76 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0228441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.34 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.18 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.19 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.7 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  31.94 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 435 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  28.95 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.51 
 
 		 361 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.92 
 
 		 217 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.39 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  30.77 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.23 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.24 
 
 		 361 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  29.41 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0386  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.48 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.166623  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.52 
 
 		 175 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>