29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2768 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  777  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  80.88 
 
 
395 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  2.97045e-06 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  61.05 
 
 
387 aa  457  1e-128  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  53.87 
 
 
396 aa  399  1e-110  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  53.12 
 
 
388 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  34.66 
 
 
377 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  30.77 
 
 
393 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  31.48 
 
 
393 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  31.48 
 
 
393 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  37.5 
 
 
391 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  37.26 
 
 
384 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  37.5 
 
 
391 aa  146  8e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  31.09 
 
 
386 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  33.59 
 
 
389 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  29.74 
 
 
390 aa  140  4e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  30.71 
 
 
403 aa  137  3e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  30.26 
 
 
393 aa  135  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  31.4 
 
 
395 aa  131  2e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  26.49 
 
 
377 aa  80.1  7e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  31.84 
 
 
371 aa  75.5  2e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  25.87 
 
 
390 aa  68.9  1e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  28.57 
 
 
287 aa  66.2  1e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  28.57 
 
 
287 aa  66.2  1e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  24.16 
 
 
376 aa  61.6  2e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  30.3 
 
 
377 aa  55.5  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  23.12 
 
 
387 aa  52  2e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22 
 
 
1868 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4149  hypothetical protein  26.63 
 
 
208 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359659  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  29.32 
 
 
356 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>