80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0467 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  273  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0945  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  82.98 
 
 
117 aa  158  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000041771  hitchhiker  0.000000340827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02180  RelE-like Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  71.05 
 
 
115 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0293585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3171  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  68.83 
 
 
111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  106  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1997  hypothetical protein  78.26 
 
 
79 aa  105  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.570421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2030  hypothetical protein  96.3 
 
 
109 aa  105  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3787  hypothetical protein  86.89 
 
 
135 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.564529  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2056  hypothetical protein  96.08 
 
 
156 aa  104  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1094  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0968333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3511  hypothetical protein  73.33 
 
 
98 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325201  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1701  hypothetical protein  84.75 
 
 
102 aa  99.4  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1020  hypothetical protein  96.08 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2231  hypothetical protein  63.89 
 
 
200 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1161  hypothetical protein  96 
 
 
95 aa  96.7  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4768  hypothetical protein  95.74 
 
 
105 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3536  hypothetical protein  52.63 
 
 
120 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1903  hypothetical protein  45.57 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4126  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  48.05 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.74132  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0484  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  52.7 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5659  hypothetical protein  47.44 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.748876  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1199  hypothetical protein  46.75 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04230  transcription repressor protein  47.37 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.611673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  56.94 
 
 
582 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1954  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  52.7 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4318  hypothetical protein  73.08 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.385835  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0284  hypothetical protein  46.38 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0140  hypothetical protein  42.86 
 
 
104 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.765789  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1646  hypothetical protein, putative phage gene  45.59 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4244  hypothetical protein  41.89 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0804  hypothetical protein  43.28 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  38.52 
 
 
277 aa  64.7  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31970  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1852  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  48.05 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.66838  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1573  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  48.05 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.233615  normal  0.0445761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1707  hypothetical protein  44.29 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  62.5 
 
 
336 aa  62  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3683  hypothetical protein  37.66 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.463091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5215  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  47.37 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  80 
 
 
2200 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  77.5 
 
 
304 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2834  hypothetical protein  44.44 
 
 
87 aa  60.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  79.49 
 
 
522 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3672  hypothetical protein  40.26 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243113  normal  0.808254 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4414  hypothetical protein  43.94 
 
 
103 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0652  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  40.62 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199942  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1024  hypothetical protein  79.49 
 
 
172 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0316  hypothetical protein  50.91 
 
 
112 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0764847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  71.43 
 
 
3275 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3603  hypothetical protein  47.54 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31040  hypothetical protein  43.48 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  76.32 
 
 
209 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  78.95 
 
 
394 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  73.17 
 
 
385 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0270  hypothetical protein  44.12 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840372  normal  0.26913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  79.49 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1021  hypothetical protein  41.27 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  54.55 
 
 
514 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  76.92 
 
 
514 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3586  hypothetical protein  73.81 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4746  hypothetical protein  75 
 
 
173 aa  57  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1525  hypothetical protein  90 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2000  hypothetical protein  73.17 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1699  hypothetical protein  76.32 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4615  hypothetical protein  76.32 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0565209  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4003  hypothetical protein  76.32 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313951  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3276  hypothetical protein  76.92 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  73.68 
 
 
305 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  81.25 
 
 
563 aa  53.9  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0425  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1913  hypothetical protein  41.18 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1116  hypothetical protein  38.89 
 
 
102 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2035  hypothetical protein  73.68 
 
 
192 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 
201 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.425253  normal  0.20556 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0181  hypothetical protein  37.97 
 
 
111 aa  50.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0069  hypothetical protein  37.97 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.138923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1992  hypothetical protein  37.97 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1851  hypothetical protein  46.75 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00587852  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3210  hypothetical protein  36.76 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700018  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1891  hypothetical protein  80 
 
 
79 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.286259  normal  0.310639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>