43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31040 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_31040  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  218  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1707  hypothetical protein  63.73 
 
 
104 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0284  hypothetical protein  52.38 
 
 
112 aa  122  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1021  hypothetical protein  53.4 
 
 
112 aa  117  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0316  hypothetical protein  52.43 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0764847 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5659  hypothetical protein  46.53 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.748876  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04230  transcription repressor protein  45.54 
 
 
104 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.611673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0140  hypothetical protein  42.57 
 
 
104 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.765789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3603  hypothetical protein  41.84 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1199  hypothetical protein  42.22 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0484  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  46.59 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4414  hypothetical protein  47.73 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2834  hypothetical protein  46.34 
 
 
87 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3672  hypothetical protein  45.36 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243113  normal  0.808254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4126  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  39.8 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.74132  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4244  hypothetical protein  40.91 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3171  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  40.91 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31970  hypothetical protein  42.22 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  39.22 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.425253  normal  0.20556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3536  hypothetical protein  45.45 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0945  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  40.7 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000041771  hitchhiker  0.000000340827 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1646  hypothetical protein, putative phage gene  39.77 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2231  hypothetical protein  43.18 
 
 
200 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02180  RelE-like Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  37.11 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0293585  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0069  hypothetical protein  36.26 
 
 
111 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.138923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1992  hypothetical protein  36.26 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0804  hypothetical protein  34.74 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1954  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  44.94 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1851  hypothetical protein  45.56 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00587852  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0181  hypothetical protein  35.16 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3683  hypothetical protein  38.64 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.463091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5215  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  43.02 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1913  hypothetical protein  39.36 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0270  hypothetical protein  35.56 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840372  normal  0.26913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  43.48 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48840  hypothetical protein  41.76 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1116  hypothetical protein  36.08 
 
 
102 aa  55.1  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0652  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  46.03 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199942  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1903  hypothetical protein  37.5 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1852  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  44.71 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.66838  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1573  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  44.71 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.233615  normal  0.0445761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5138  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  45.07 
 
 
78 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517981  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3210  hypothetical protein  35.14 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>